RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA8RI6L899 631 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCD4O14678 606 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 F13BP05160 661 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEFLP07196 543 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MGAT1P26572 445 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR8K3Q8NH51 312 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ULK4Q96C45 1275 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PEBP4Q96S96 227 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSG101Q99816 390 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEC14L2O76054 403 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TYRO3Q06418 890 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZP4Q12836 540 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP4K2Q12851 820 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOMM20Q15388 145 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIP10Q15642 601 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MPEG1Q2M385 716 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIGGQ5H8A4 983 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAF3Q5VWG9 929 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BEND4Q6ZU67 534 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNRHR2Q96P88 292 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS16Q9H269 839 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF122Q9H9V4 155 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HACD3Q9P035 362 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCNCP24863 283 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KHKP50053 298 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LHX2P50458 406 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BRD3Q15059 726 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 F13A1P00488 732 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC35E2P0CK97 266 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PGCP20142 388 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLDN18P56856 261 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT81Q14533 505 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELMO1Q92556 727 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSGA13Q96PP4 275 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAN1B1Q9UKM7 699 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF114Q9Y508 228 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 J3QLI3 93 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BIN1O00499 593 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHST10O43529 356 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XPNPEP2O43895 674 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRATO95237 230 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF708P17019 499 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF4P78317 190 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STK38Q15208 465 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAMKVQ8NCB2 501 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FIG4Q92562 907 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NXNL1Q96CM4 212 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms