RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MKLN1Q9UL63 735 aa17.78■□□□□ 0.44
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SH3BP1-202ENST00000417536 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3D21A4FU49 640 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFA1P59665 94 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFA3P59666 94 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
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SH3BP1-202ENST00000417536 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
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SH3BP1-202ENST00000417536 GPR65Q8IYL9 337 aa17.78■□□□□ 0.44
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SH3BP1-202ENST00000417536 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa17.77■□□□□ 0.44
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SH3BP1-202ENST00000417536 CTRCQ99895 268 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa17.77■□□□□ 0.44
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SH3BP1-202ENST00000417536 OR8H2Q8N162 312 aa17.77■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 TLR4O00206 839 aa17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC34A3Q8N130 599 aa17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 C5orf67F2Z3F1 127 aa17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 PPP2R2DQ66LE6 453 aa17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 WDR34Q96EX3 536 aa17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TAPBPLQ9BX59 468 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ASPNQ9BXN1 380 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 HHATLQ9HCP6 504 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PLAGL1Q9UM63 463 aa17.76■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 K7ESM1 405 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 UQCRC2P22695 453 aa17.75■□□□□ 0.43
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SH3BP1-202ENST00000417536 NNMTP40261 264 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 ETV6P41212 452 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK9P45984 424 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC15A1P46059 708 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC38A5Q8WUX1 472 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3R3Q92569 461 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 TMCC3Q9ULS5 477 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NUMA1Q14980 2115 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
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