RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.83■□□□□ 0.93
CLDN5-201ENST00000403084 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 C7orf66A4D0T2 115 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 RECKO95980 971 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 CBSLP0DN79 551 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ACRV1P26436 265 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 CBSP35520 551 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 PSEN2P49810 448 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 NFATC2Q13469 925 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 HEPACAMQ14CZ8 416 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 PLA1AQ53H76 456 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 OR11H7Q8NGC8 314 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 HUS1BQ8NHY5 278 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 WACQ9BTA9 647 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ISYNA1Q9NPH2 558 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 RNF181Q9P0P0 153 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 RHCGQ9UBD6 479 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 RAB23Q9ULC3 237 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 FKBP7Q9Y680 259 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 TSPAN4O14817 238 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF623O75123 536 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 SERPINI2O75830 405 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 POMCP01189 267 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 IFNA14P01570 189 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 BDKRB1P46663 353 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 WNT4P56705 351 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF33BQ06732 778 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 GPR176Q14439 515 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 TCEANCQ8N8B7 351 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 OR52N2Q8NGI0 321 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 UBQLN2Q9UHD9 624 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.82■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 A0A1B0GVM2 712 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 H3BNC9 293 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 IDSP22304 550 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ATP12AP54707 1039 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 UTRNP46939 3433 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 FZD6O60353 706 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 SOX14O95416 240 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ANXA3P12429 323 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ITGALP20701 1170 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 STOMP27105 288 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 SLC6A4P31645 630 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ASMTP46597 345 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 CASP9P55211 416 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 CYP4F8P98187 520 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 FABP5Q01469 135 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 LRRC74AQ0VAA2 488 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 DSG2Q14126 1118 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ARSKQ6UWY0 536 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 SCMH1Q96GD3 660 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 GHITMQ9H3K2 345 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 MGAT4BQ9UQ53 548 aa20.81■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 TRBC2A0A5B9 178 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 CASKO14936 926 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 PRKACAP17612 351 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 GABRA5P31644 462 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 XKP51811 444 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ADAM15Q13444 863 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 LRRC32Q14392 662 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 MBTPS1Q14703 1052 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 C3orf38Q5JPI3 329 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.8■□□□□ 0.92
CLDN5-201ENST00000403084 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms