RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 OOSP2Q86WS3 158 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MALT1Q9UDY8 824 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 RPS6KA6Q9UK32 745 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 STON1Q9Y6Q2 735 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR179Q6PRD1 2367 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A0B4J293 547 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A0G2JN53 185 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 QSOX1O00391 747 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 BTN3A3O00478 584 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 OR7A10O76100 309 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CATP04040 527 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GZMKP49863 264 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ASZ1Q8WWH4 475 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 FATE1Q969F0 183 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PITX2Q99697 317 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CCDC3Q9BQI4 270 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 DIABLOQ9NR28 239 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 V9GYH0 126 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 DOCK6Q96HP0 2047 aa10.69□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TSPAN4O14817 238 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 KPNA5O15131 536 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR39O43194 453 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ASGR2P07307 311 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.72e-6■■□□□ 12.8
RPRD1B-201ENST00000373433 GGT2P36268 569 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 NUDT1P36639 197 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 C5orf22Q49AR2 442 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PLCZ1Q86YW0 608 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 OR8H3Q8N146 312 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 B3GNT7Q8NFL0 401 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 OR4M1Q8NGD0 313 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2A12Q8NGT7 310 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CCM2Q9BSQ5 444 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SRRQ9GZT4 340 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ING3Q9NXR8 418 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 IL17CQ9P0M4 197 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GULP1Q9UBP9 304 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TRAPPC4Q9Y296 219 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 KLK4Q9Y5K2 254 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1W2PP55 124 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 LEUTXA8MZ59 168 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PEX11BO96011 259 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CKMT1AP12532 417 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 RORCP51449 518 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CRTC1Q6UUV9 634 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF767PQ75MW2 155 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PRSS58Q8IYP2 241 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ESX1Q8N693 406 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SELENOMQ8WWX9 145 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CHFRQ96EP1 664 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MSANTD3Q96H12 275 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 BARHL1Q9BZE3 327 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CLMPQ9H6B4 373 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 STOML2Q9UJZ1 356 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 EPN2O95208 641 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ANXA5P08758 320 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 BCKDHAP12694 445 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TNFRSF1BP20333 461 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 KDELR2P33947 212 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC16A1P53985 500 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 NFE2L1Q14494 772 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 GRIN2CQ14957 1233 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM220Q6QAJ8 160 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC51BQ86UW2 128 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 TIGD4Q8IY51 512 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZBTB2Q8N680 514 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 NUS1Q96E22 293 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MTERF3Q96E29 417 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 MIEF1Q9NQG6 463 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 KCTD5Q9NXV2 234 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 CMAHPQ9Y471 501 aa10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
RPRD1B-201ENST00000373433 PLD2O14939 933 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms