RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 UGT1A8Q9HAW9 530 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 S100A14Q9HCY8 104 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PXMP2Q9NR77 195 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ARMCX1Q9P291 453 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CCPG1Q9ULG6 757 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PLLPQ9Y342 182 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PSME4Q14997 1843 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf226A1L170 272 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FAM159BA6NKW6 160 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 YDJCA8MPS7 323 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 KBTBD13C9JR72 458 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 H0YCG3 227 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PDLIM1O00151 329 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CYB561D2O14569 222 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF195O14628 629 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CHADO15335 359 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 AVILO75366 819 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LRCH4O75427 683 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SPAG6O75602 509 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CIB2O75838 187 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 NKX2-2O95096 273 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PENKP01210 267 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 APOC2P02655 101 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 BPGMP07738 259 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SERPINA6P08185 405 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 KRT7P08729 469 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 UQCRBP14927 111 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 IL7RP16871 459 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PSMA2P25787 234 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MAGEA3P43357 314 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MAGEA6P43360 314 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LIG4P49917 911 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 AP3M2P53677 418 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 AQP5P55064 265 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MYL6P60660 151 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 RPL26P61254 145 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 RPS6P62753 249 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 DYNLT1P63172 113 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CNTN2Q02246 1040 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 KDSRQ06136 332 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 GALNT2Q10471 571 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 STX3Q13277 289 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 P2RY6Q15077 328 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CHI3L2Q15782 390 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PTPN20Q4JDL3 420 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LIN52Q52LA3 116 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 XKR3Q5GH77 459 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MDH1BQ5I0G3 518 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CYP4A22Q5TCH4 519 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 C6orf163Q5TEZ5 329 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FKBP1CQ5VVH2 108 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SLC26A11Q86WA9 606 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CPXCR1Q8N123 301 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SLC4A11Q8NBS3 891 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 KCTD6Q8NC69 237 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM35BQ8NCS4 154 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 MCUQ8NE86 351 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 NAT14Q8WUY8 206 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 STMN2Q93045 179 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 DTNBP1Q96EV8 351 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 CFAP36Q96G28 342 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 NDNQ99608 321 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 THTPAQ9BU02 230 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 WWP1Q9H0M0 922 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SDCBP2Q9H190 292 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 LHX5Q9H2C1 402 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 ANK1P16157 1881 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PARP14Q460N5 1801 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 PTPRFP10586 1907 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 RLFQ13129 1914 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-202ENST00000368205 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms