RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361731.3

SFT2D1-201, Transcript of SFT2 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFT2D1, Length 1,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1-201ENST00000361731 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 KIAA1328Q86T90 577 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 PALM2Q8IXS6 379 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SLC15A4Q8N697 577 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 RNF214Q8ND24 703 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 OR2L5Q8NG80 312 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CALML6Q8TD86 181 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 BDH2Q9BUT1 245 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa14.61□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TRIM64BA6NI03 449 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 B3GALT2O43825 422 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 PRAMEF4O60810 478 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 IFNA16P05015 189 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CERS1P27544 350 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SOX18P35713 384 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 KIF5AQ12840 1032 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 DCST1Q5T197 706 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ISL2Q96A47 359 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SERINC2Q96SA4 455 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 NT5DC2Q9H857 520 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CNIH4Q9P003 139 aa14.6□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SH3D21A4FU49 640 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 HRKO00198 91 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CLEC3AO75596 197 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 GUCA1CO95843 209 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 AHSGP02765 367 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 HPNP05981 417 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 GSTM2P28161 218 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 OPRM1P35372 400 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 IL2P60568 153 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 KCNJ2P63252 427 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SERTAD2Q14140 314 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 26.3
SFT2D1-201ENST00000361731 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 GALNT7Q86SF2 657 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 GPATCH11Q8N954 259 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TTLQ8NG68 377 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 FAR2Q96K12 515 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 DESI2Q9BSY9 194 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 CALHM2Q9HA72 323 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 LYRM4Q9HD34 91 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 GALNT8Q9NY28 637 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.59□□□□□ -0.07
SFT2D1-201ENST00000361731 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 SMPD2O60906 423 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 LDB3O75112 727 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 CRLF1O75462 422 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 CCDC175P0C221 793 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 SAT1P21673 171 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 SLCO1A2P46721 670 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 SLC6A12P48065 614 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 PLA2G16P53816 162 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 MTTPP55157 894 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 FOXF2Q12947 444 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 NTRK2Q16620 822 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.58□□□□□ -0.08
SFT2D1-201ENST00000361731 P3H2Q8IVL5 708 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms