RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM229AH3BQW9 127 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R296 226 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PROM1O43490 865 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3BP5O60239 455 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CREG1O75629 220 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNK5O95279 499 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 B3GALT4O96024 378 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 RETP07949 1114 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ALPPL2P10696 532 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TDGF1P13385 188 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PVRP15151 417 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GLB1P16278 677 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CRATP43155 626 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 LSSP48449 732 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 VAC14Q08AM6 782 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 BNIP3Q12983 259 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 VEZF1Q14119 521 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SPIDRQ14159 915 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 VMACQ2NL98 169 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 WLSQ5T9L3 541 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 BHLHB9Q6PI77 547 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4N4Q8N0Y3 316 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 EID3Q8N140 333 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CSNK1A1LQ8N752 337 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf65Q8NCR3 313 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP76Q8TAP6 659 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NCSTNQ92542 709 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PIGKQ92643 395 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM10Q96HG1 83 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CD180Q99467 661 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PKP2Q99959 881 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 AICDAQ9GZX7 198 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 PILRBQ9UKJ0 227 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX8Q9Y5X2 465 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TLCD2A6NGC4 264 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 YKT6O15498 198 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNA14P01570 189 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 RAP2AP10114 183 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ST6GAL1P15907 406 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ACADSP16219 412 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 IL1RNP18510 177 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CPN2P22792 545 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CERS1P27544 350 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXD12P35452 270 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL4DP49703 201 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GPLD1P80108 840 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 RBBP4Q09028 425 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF11Q15544 211 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFA9Q16795 377 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 MPEG1Q2M385 716 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB134Q4QY38 66 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC30A8Q8IWU4 369 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRG5Q8IZF4 528 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CARFQ8N187 725 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 AMER3Q8N944 861 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 EME1Q96AY2 570 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO4A1Q96BD0 722 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF145Q96MT1 663 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 SEPHS2Q99611 448 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP3K3Q99759 626 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 BDH2Q9BUT1 245 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CHID1Q9BWS9 393 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms