RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GP1BBP13224 206 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF20P17024 532 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ATF6P18850 670 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SUOXP51687 545 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 RCAN2Q14206 197 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 FANK1Q8TC84 345 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC39A13Q96H72 371 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 UPB1Q9UBR1 384 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ATP6V1G1O75348 118 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 DRD2P14416 443 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 HTRA3P83110 453 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SUN3Q8TAQ9 357 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 LGALS12Q96DT0 336 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 MMP27Q9H306 513 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC1A7O00341 560 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CSN2P05814 226 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 F8A1P23610 371 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GABRB3P28472 473 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC6A9P48067 706 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GRIN2CQ14957 1233 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF613Q6PF04 617 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 NAGSQ8N159 534 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 JAGN1Q8N5M9 183 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM156Q8N614 296 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GPR174Q9BXC1 333 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TFPTP0C1Z6 253 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 NTSR1P30989 418 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GCGRP47871 477 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC5A8Q8N695 610 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR4K17Q8NGC6 315 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SAMD11Q96NU1 681 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CSTAP01040 98 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SDC1P18827 310 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SCRN3Q0VDG4 424 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ARFRP1Q13795 201 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 AAK1Q2M2I8 961 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SHDQ96IW2 340 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 EBF1Q9UH73 591 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 NPIPA5E9PKD4 350 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CSF2P04141 144 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 IL1RNP18510 177 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CLCN2P51788 898 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR2T33Q8NG76 320 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM181Q9P2C4 612 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GRHPRQ9UBQ7 328 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 NPIPA1Q9UND3 350 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.47□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 FCER2P06734 321 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 DCTP40126 519 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR3A3P47888 321 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR3A2P47893 321 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SGCBQ16585 318 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CSNK1A1LQ8N752 337 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ABI3Q9P2A4 366 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 C5AR1P21730 350 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OXTRP30559 389 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CD83Q01151 205 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.46□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CCDC80Q76M96 950 aa9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms