RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 DBF4BQ8NFT6 615 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 OR2T33Q8NG76 320 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 OR10G6Q8NH81 332 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 ERI3O43414 337 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 POP7O75817 140 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PRKACBP22694 351 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PIGAP37287 484 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 SOX3P41225 446 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 DAPP51397 102 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 HK3P52790 923 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 CAP1Q01518 475 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PAQR7Q86WK9 346 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 MCHR1Q99705 422 aa18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 FGFBP1Q14512 234 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 ARSIQ5FYB1 569 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 CES4AQ5XG92 561 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 SLC25A25Q6KCM7 469 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PAQR9Q6ZVX9 377 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 CHST4Q8NCG5 386 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 ZNF563Q8TA94 476 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 WDR48Q8TAF3 677 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 CLIP3Q96DZ5 547 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 METTL15A6NJ78 407 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 RFPL3O75679 317 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 ISL1P61371 349 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PON3Q15166 354 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 SEC23BQ15437 767 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 ACBD7Q8N6N7 88 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 ZNF676Q8N7Q3 588 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 NUDT15Q9NV35 164 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 NDOR1Q9UHB4 597 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 FBXO10Q9UK96 956 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 MCIDASD6RGH6 385 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 UGDHO60701 494 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 TOXO94900 526 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 GPR68Q15743 365 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 GPR19Q15760 415 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 CCL14Q16627 93 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 Q6ZVL8 140 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 NUS1Q96E22 293 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 TMEM5Q9Y2B1 443 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 MED31Q9Y3C7 131 aa18.48■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 METTL21EPA6NDL7 271 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 CD8B2A6NJW9 211 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 COCHO43405 550 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 CXCL14O95715 111 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 CAPNS1P04632 268 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 CD8BP10966 210 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 MLLT10P55197 1068 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 SLC25A24Q6NUK1 477 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 C6orf120Q7Z4R8 191 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 CEACAM19Q7Z692 300 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 ZFP41Q8N8Y5 198 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 OR4K5Q8NGD3 323 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 SCN2BO60939 215 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 KCNC1P48547 511 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 DNASE1L1P49184 302 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 FRMPD2BQ6IN97 320 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 SUSD1Q6UWL2 747 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 SYNPOQ8N3V7 929 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 OR2T11Q8NH01 316 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 GJB5O95377 273 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 IL1AP01583 271 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 OR12D1P0DN82 309 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 BPIP17213 487 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 AMD1P17707 334 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 FPGSQ05932 587 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 28.1
USP48-201ENST00000308271 SLC14A2Q15849 920 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 TXNDC8Q6A555 127 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 KLBQ86Z14 1044 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 MDGA1Q8NFP4 955 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 TMEM221A6NGB7 291 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PCCBP05166 539 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 ADORA3P0DMS8 318 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 BCL2L15Q5TBC7 163 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 UNC5DQ6UXZ4 953 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 QSOX2Q6ZRP7 698 aa18.47■□□□□ 0.55
USP48-201ENST00000308271 UBQLNLQ8IYU4 475 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms