RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299240.10

TTC17-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC17, Length 3,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-202ENST00000299240 FZD5Q13467 585 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 CYBRD1Q53TN4 286 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TMEM64Q6YI46 380 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 FAIM2Q9BWQ8 316 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 IL20RAQ9UHF4 553 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 M0R3H8 397 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 ABHD18Q0P651 414 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TMEM151BQ8IW70 566 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 FAM9CQ8IZT9 166 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 GATSQ8NAP1 163 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 CTRCQ99895 268 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 C19orf43Q9BQ61 176 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 UGT2B28Q9BY64 529 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 OR51I1Q9H343 314 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 FBRSQ9HAH7 460 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa11.93□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TMEM247A6NEH6 219 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 OR6B1O95007 311 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 SOX14O95416 240 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 IL7RP16871 459 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 DDCP20711 480 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 HTR1EP28566 365 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 PIK3CBP42338 1070 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 OCA2Q04671 838 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 GRIK2Q13002 908 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 RUNX2Q13950 521 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 DUSP7Q16829 419 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 EID2Q8N6I1 236 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 OR2L5Q8NG80 312 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 GPATCH2Q9NW75 528 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 MCM8Q9UJA3 840 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 GPR37L1O60883 481 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 ACADSP16219 412 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 RRM2P31350 389 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 DSTNP60981 165 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 YPEL5P62699 121 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 IL5RAQ01344 420 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 STX4Q12846 297 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 NEDD8Q15843 81 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 WLSQ5T9L3 541 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 LCN8Q6JVE9 175 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 P3H2Q8IVL5 708 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 OR8J3Q8NGG0 315 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TESCQ96BS2 214 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TMEM19Q96HH6 336 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 QRFPRQ96P65 431 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 VNN3Q9NY84 501 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 SPATA7Q9P0W8 599 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 SLC13A4Q9UKG4 626 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 B3GALT2O43825 422 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 NR2F6P10588 404 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 ALOX12P18054 663 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 ELK4P28324 431 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 EPHA2P29317 976 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 HSD17B2P37059 387 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 BTG2P78543 158 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 DAB2P98082 770 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 HACD2Q6Y1H2 254 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 C16orf62Q7Z3J2 963 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 PTOV1Q86YD1 416 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 ZFP90Q8TF47 636 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 PIK3R3Q92569 461 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 RERGLQ9H628 205 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.92□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.91□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 TRBC2A0A5B9 178 aa11.91□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 AQP12BA6NM10 295 aa11.91□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 SERPINI2O75830 405 aa11.91□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 KLHL18O94889 574 aa11.91□□□□□ -0.5
TTC17-202ENST00000299240 RAP2AP10114 183 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms