RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295992.7

PCOLCE2-201, Transcript of procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCOLCE2, Length 2,021 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2-201ENST00000295992 SOAT1P35610 550 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 KLHL17Q6TDP4 642 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZNF367Q7RTV3 350 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 FAM129CQ86XR2 697 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 B3GNT7Q8NFL0 401 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 UBE2E3Q969T4 207 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 PDXPQ96GD0 296 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 CDCA4Q9BXL8 241 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 OR51E2Q9H255 320 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 TRIOO75962 3097 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 DSPPQ9NZW4 1301 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 RGS6P49758 472 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 ARMCX4Q5H9R4 360 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 COLEC12Q5KU26 742 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 LCTLQ6UWM7 567 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 KBTBD8Q8NFY9 601 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 ARRDC3Q96B67 414 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 NUS1Q96E22 293 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 SP140LQ9H930 580 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 IMPAD1Q9NX62 359 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 RAB23Q9ULC3 237 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa22.11■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 SH3D21A4FU49 640 aa22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 CRISP3P54108 245 aa22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 SAXO2Q658L1 398 aa22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 AQP11Q8NBQ7 271 aa22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 POLE4Q9NR33 117 aa22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 IFT52Q9Y366 437 aa22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 KLK4Q9Y5K2 254 aa22.1■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 FFAR1O14842 300 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 PI15O43692 258 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 TBX19O60806 448 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 DBTP11182 482 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 GLULP15104 373 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 CHMP24386 653 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 GANABQ14697 944 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 MAPK11Q15759 364 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 DUSP7Q16829 419 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZNF181Q2M3W8 571 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 GJD3Q8N144 294 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 AMER2Q8N7J2 671 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 RNF167Q9H6Y7 350 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 EFCAB10A6NFE3 127 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 SAGE2PA6NJ88 616 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 POP7O75817 140 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 GASTP01350 101 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 POU2F1P14859 743 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 SLC15A1P46059 708 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 CRISP1P54107 249 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 LIM2P55344 173 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 CDC42P60953 191 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 REEP3Q6NUK4 255 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 NLGN4XQ8N0W4 816 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 OR2L2Q8NH16 312 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 NEURL3Q96EH8 262 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 IL17FQ96PD4 163 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 OR52A5Q9H2C5 316 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 A4GALTQ9NPC4 353 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 TAS2R16Q9NYV7 291 aa22.09■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 F5P12259 2224 aa22.08■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 PRRT4C9JH25 899 aa22.08■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 KAT7O95251 611 aa22.08■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 IFNW1P05000 195 aa22.08■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 ITGB7P26010 798 aa22.08■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 GPR1P46091 355 aa22.08■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 OLR1P78380 273 aa22.08■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 PRKCDQ05655 676 aa22.08■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 DPTQ07507 201 aa22.08■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 NFE2L1Q14494 772 aa22.08■■□□□ 1.13
PCOLCE2-201ENST00000295992 RAET1GQ6H3X3 334 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms