RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263665.6

CNTN3-201, Transcript of contactin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNTN3, Length 4,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3-201ENST00000263665 PRRT4C9JH25 899 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 HRO43593 1189 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 HPGDSO60760 199 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ATG12O94817 140 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CKMP06732 381 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RD3LP0DJH9 198 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 GIMD1P0DJR0 217 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RHCEP18577 417 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CPT2P23786 658 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 DDTP30046 118 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 OR2B8PP59922 312 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 NFIXQ14938 502 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PDIA6Q15084 440 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 DHCR24Q15392 516 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TMUB2Q71RG4 321 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 GALNT10Q86SR1 603 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 GJD3Q8N144 294 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 LINC00471Q8N535 108 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TMEM18Q96B42 140 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SCMH1Q96GD3 660 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PIK3C2AO00443 1686 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TMEM218A2RU14 115 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 LINC00587B1AMM8 73 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CYB561D2O14569 222 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SEC22BO75396 215 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 LINC00614P0C842 121 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 C6P13671 934 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 TYMPP19971 482 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 BDKRB2P30411 391 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 DLSTP36957 453 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SOX9P48436 509 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PITPNBP48739 271 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PPP3CAQ08209 521 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PARP15Q460N3 678 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RDH10Q8IZV5 341 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 RNF139Q8WU17 664 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SMARCD2Q92925 531 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CIPCQ9C0C6 399 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PDE7BQ9NP56 450 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 GPR160Q9UJ42 338 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 KCTD3Q9Y597 815 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.6□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 GALP22466 123 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CYP2F1P24903 491 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 MAN2A2P49641 1150 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ADAM8P78325 824 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ACSM1Q08AH1 577 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PCLAFQ15004 111 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZNF691Q5VV52 312 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SV2AQ7L0J3 742 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ARL14Q8N4G2 192 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ZNF383Q8NA42 475 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 BVESQ8NE79 360 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 WDR48Q8TAF3 677 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PIGQQ9BRB3 760 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PINK1Q9BXM7 581 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 LHX5Q9H2C1 402 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 UBQLN3Q9H347 655 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 MED9Q9NWA0 146 aa6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNTN3-201ENST00000263665 CNTN3Q9P232 1028 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms