RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 OR8J3Q8NGG0 315 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ZNF675Q8TD23 568 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 OVCA2Q8WZ82 227 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 FGF13Q92913 245 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 OTUB2Q96DC9 234 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 LRR1Q96L50 414 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TEX37Q96LM6 180 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TGM7Q96PF1 710 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 OR2M4Q96R27 311 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TAPBPLQ9BX59 468 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SLC12A9Q9BXP2 914 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MED28Q9H204 178 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MARK1Q9P0L2 795 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 POLEQ07864 2286 aa5.28□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GVC2 190 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 A6NIN4 97 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 DRGXA6NNA5 263 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 I6L893 689 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SLC1A7O00341 560 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RASAL1O95294 804 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 B3GALT4O96024 378 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 HMGN1P05114 100 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 MYOGP15173 224 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 EDNRAP25101 427 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CCKBRP32239 447 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 DNASE1L1P49184 302 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ATP4BP51164 291 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SP140Q13342 867 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 LRP8Q14114 963 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CTC1Q2NKJ3 1217 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CCSMST1Q4G0I0 132 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 C1orf189Q5VU69 101 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 C22orf42Q6IC83 251 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 UGT2A3Q6UWM9 527 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TMEM207Q6UWW9 146 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 USP43Q70EL4 1123 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CENPSQ8N2Z9 138 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 GINS4Q9BRT9 223 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SLC17A9Q9BYT1 436 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PRG6 482 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 HHLA1C9JL84 531 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PLOD2O00469 737 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 HCRTR2O43614 444 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SCO2O43819 266 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 FGF4P08620 206 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RPS17P08708 135 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 HSD17B1P14061 328 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 GCGRP47871 477 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CD97P48960 835 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 PON3Q15166 354 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 LPAL2Q16609 132 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 LCN8Q6JVE9 175 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZSR9 355 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ABHD13Q7L211 337 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 AMIGO1Q86WK6 493 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 VRK3Q8IV63 474 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.27□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 C16orf78Q8WTQ4 265 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms