RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PS29 197 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 NPIPB8E9PQR5 432 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ITM2AO43736 263 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 DPM1O60762 260 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 GPR75O95800 540 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB5P36952 375 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 MAPK12P53778 367 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 SERTAD2Q14140 314 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0040Q15053 153 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 Q8NA96 180 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 MFRPQ9BY79 579 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 KCNK13Q9HB14 408 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 MCM8Q9UJA3 840 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.8■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP10A1A4S6 786 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 DDAH2O95865 285 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 SLC18A1P54219 525 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 AP2B1P63010 937 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 BTKQ06187 659 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A19Q695T7 634 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 FCRLBQ6BAA4 426 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZS92 163 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 CLYBLQ8N0X4 340 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 OR2T11Q8NH01 316 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa20.79■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 TMEM120BA0PK00 339 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 A8MUI8 341 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 CRCPO75575 148 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 PRPH2P23942 346 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 STT3AP46977 705 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 CHI3L2Q15782 390 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 SPIN4Q56A73 249 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ARMC10Q8N2F6 343 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ZNF321PQ8N8H1 164 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 HAS2Q92819 552 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 NCLNQ969V3 563 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G3Q9NZ20 509 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 HEY2Q9UBP5 337 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 PCDH7O60245 1069 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 IFNA16P05015 189 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 SERPINE1P05121 402 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.925e-6■■■■□ 20.9
SYF2-201ENST00000236273 CASRP41180 1078 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 BIKQ13323 160 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ACER2Q5QJU3 275 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 ZADH2Q8N4Q0 377 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.923e-13■■■■■ 36.7
SYF2-201ENST00000236273 SH3GL2Q99962 352 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 EPN3Q9H201 632 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 STMN3Q9NZ72 180 aa20.78■□□□□ 0.92
SYF2-201ENST00000236273 TMEM200CA6NKL6 621 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 C17orf105B2RV13 164 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 HRKO00198 91 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 WDPCPO95876 746 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 LINC00032P0C843 101 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 BGNP21810 368 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF750Q32MQ0 723 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SH2D4BQ5SQS7 431 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SLC48A1Q6P1K1 146 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 MORN4Q8NDC4 146 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 OR14A16Q8NHC5 309 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 DOK4Q8TEW6 326 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 ZNF721Q8TF20 911 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 C16orf78Q8WTQ4 265 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 TM9SF4Q92544 642 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 SORT1Q99523 831 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 EBPLQ9BY08 206 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 WDR41Q9HAD4 459 aa20.77■□□□□ 0.91
SYF2-201ENST00000236273 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms