RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cd83O88324 196 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tk1P04184 233 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc7a2P18581 657 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cox5bP19536 128 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 DctP29812 517 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cd86P42082 309 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Limk1P53668 647 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tcfl5Q32NY8 489 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc2a9Q3T9X0 538 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hhla1Q3TYV2 514 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ccdc185Q3V118 621 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Spata13Q5DU57 656 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 AbrQ5SSL4 859 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Znrf3Q5SSZ7 913 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Laptm5Q61168 261 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Kcna5Q61762 602 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 MffQ6PCP5 291 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cnksr3Q8BMA3 555 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Grik4Q8BMF5 956 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ssuh2Q8C3L1 340 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pih1d2Q8CHR9 315 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ift80Q8K057 777 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PurgQ8R4E6 350 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Acss1Q99NB1 682 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tspan4Q9DCK3 238 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 C1qtnf3Q9ES30 246 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Prr23a2D3YWX5 253 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rnf169E9Q7F2 694 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm17555F6U8B9 371 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mup13L7N222 235 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 AcrP23578 436 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lmo2P25801 158 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cdh10P70408 788 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Abraxas2Q3TCJ1 415 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm773Q3TML4 206 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CenplQ3U3S3 329 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TceancQ3US16 359 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GcdhQ60759 438 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Clcn4Q61418 747 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gdi2Q61598 445 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TsnQ62348 228 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Egfl8Q6GUQ1 293 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Klhl6Q6V595 619 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 P4ha3Q6W3F0 542 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trim50Q810I2 483 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ankrd45Q810N6 248 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gen1Q8BMI4 908 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 SprnQ8BWU1 147 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Frmd6Q8C0V9 622 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Aoc1Q8JZQ5 751 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CenpiQ8K1K4 746 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr769Q8K501 312 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr633Q8VF02 312 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pcdhb19Q91Y01 801 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Twf1Q91YR1 350 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sntg1Q925E1 517 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 2410137M14RikQ9CWF0 162 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ly6kQ9CWP4 154 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trim13Q9CYB0 407 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dusp12Q9D0T2 339 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Efhc2Q9D485 750 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 MtfmtQ9D799 386 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Prss52Q9D9M0 321 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc38a3Q9DCP2 505 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zbtb18Q9WUK6 522 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 IlkO55222 452 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ptger3P30557 365 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TtkP35761 856 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 InmtP40936 264 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc1a5P51912 553 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 MazP56671 477 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 JupQ02257 745 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 SPINDOCQ05AH6 381 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Prss55Q14BX2 321 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pnrc1Q3TWH3 297 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nudt18Q3U2V3 323 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1417Q8VGJ6 315 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Brinp1Q920P3 760 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pttg1Q9CQJ7 199 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 DlstQ9D2G2 454 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 BlnkQ9QUN3 457 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Avpr1bQ9WU02 421 aa11.13□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ttc39aA2ACP1 578 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Skint10A7TZG1 354 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dlgap4B1AZP2 992 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 2610001J05RikF2Z3Y9 59 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gstp3F6RWR5 210 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ccl26F8VQM2 93 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ucp2P70406 309 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Q3KNL4 93 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm11487Q5RIS0 354 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Bloc1s3Q5U5M8 195 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Icam5Q60625 917 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tnfaip3Q60769 775 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sema4cQ64151 834 aa11.12□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Znf512Q69Z99 562 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.5 ms