RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT6CP48668 564 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ART3Q13508 389 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 NAE1Q13564 534 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 NAA25Q14CX7 972 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1N1Q8NGS0 311 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 NR4A3Q92570 626 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A18Q96BI1 424 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR34Q96EX3 536 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CRB3Q9BUF7 120 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf21Q9H246 121 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTR8Q9H981 624 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNE2Q9Y6J6 123 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQ72 361 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT87PA6NCN2 255 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 E7ENX8 843 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC28A1O00337 649 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM1AO60341 852 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ULK1O75385 1050 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 COX6A1P12074 109 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMB5P28074 263 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 HNF4AP41235 474 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFSF10P50591 281 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TAP2Q03519 686 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SQLEQ14534 574 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTA3Q16772 222 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 WASHC2DQ5SRD0 308 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 DDIASQ8IXT1 998 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4N4Q8N0Y3 316 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX31Q8N9S9 440 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL29Q96CT2 875 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf90Q96M02 699 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 EHD1Q9H4M9 534 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G3Q9NZ20 509 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX6Q9UNH7 406 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00032P0C843 101 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ACPPP15309 386 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 GNAZP19086 355 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PNLIPRP1P54315 467 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 SF1Q15637 639 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZSR9 355 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK15Q96Q40 435 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PCNX1Q96RV3 2341 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC168Q8NDH2 2452 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PPV9 198 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 HYKKA2RU49 373 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 MANBAO00462 879 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CLGNO14967 610 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 WISP2O76076 250 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 YBX1P67809 324 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM214AQ32MH5 1076 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS58Q8IYP2 241 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB42Q8N4Z0 105 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PYCR2Q96C36 320 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP3R2Q96LZ3 170 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF304Q9HCX3 659 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf18Q9UK00 162 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL27Q9Y4X3 112 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS14O43566 566 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP9O95302 570 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 CELA2AP08217 269 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 IDO1P14902 403 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 NPPBP16860 134 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 MST1P26927 711 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 IRF8Q02556 426 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 VWA2Q5GFL6 755 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF44Q7L0R7 432 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 HAS2Q92819 552 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC120Q96HB5 630 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4K3Q96R72 315 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 BTBD10Q9BSF8 475 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 HAUS8Q9BT25 410 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 H0YIV9 168 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPH2P23942 346 aa22.69■■□□□ 1.22
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