RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR48	Q8TAF3	677 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	IFI44	Q8TCB0	444 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC39A7	Q92504	469 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PTP4A1	Q93096	173 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PYCR2	Q96C36	320 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	LOXL4	Q96JB6	756 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC30A3	Q99726	388 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX101	Q9BY14	249 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DSN1	Q9H410	356 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PPM1D	O15297	605 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	AHSG	P02765	367 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GNAO1	P09471	354 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SFTPC	P11686	197 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NSG1	P42857	185 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	BDKRB1	P46663	353 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MS4A2	Q01362	244 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CEACAM7	Q14002	265 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PROX2	Q3B8N5	592 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	XAF1	Q6GPH4	301 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CHSY3	Q70JA7	882 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL14	Q8N4G2	192 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MCU	Q8NE86	351 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TADA1	Q96BN2	335 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MED8	Q96G25	268 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	LYSMD1	Q96S90	227 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ING3	Q9NXR8	418 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC16A	O15027	2179 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ATRX	P46100	2492 aa		6.91	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495		I3L521	148 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ANGPT2	O15123	496 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GMDS	O60547	372 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT34	O76011	436 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SERPIND1	P05546	499 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	BPGM	P07738	259 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PVR	P15151	417 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CBL	P22681	906 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CCR7	P32248	378 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CAPG	P40121	348 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TTPA	P49638	278 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL4D	P49703	201 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	IDH3A	P50213	366 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SUOX	P51687	545 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TNK1	Q13470	666 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CTF1	Q16619	201 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	STX12	Q86Y82	276 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RSC1A1	Q92681	617 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	FATE1	Q969F0	183 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	C12orf57	Q99622	126 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	EGFL8	Q99944	293 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX15	Q9NRS6	342 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TINAG	Q9UJW2	476 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	LHX6	Q9UPM6	363 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MROH6	A6NGR9	719 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ISM1	B1AKI9	464 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	LMO7DN	F2Z398	122 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SOCS2	O14508	198 aa		6.9	□□□□□ -1.3

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