RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 OPTCQ9UBM4 332 aa20.47■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa20.47■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 SUPT3HB4E1H0 165 aa20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 SUPT3HO75486 399 aa20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 MDGA2Q7Z553 956 aa20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 OR7G3Q8NG95 312 aa20.46■□□□□ 0.87
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SRRT-218ENST00000620394 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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SRRT-218ENST00000620394 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 PLSCR2Q9NRY7 297 aa20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 MYOTQ9UBF9 498 aa20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.46■□□□□ 0.87
SRRT-218ENST00000620394 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.46■□□□□ 0.87
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SRRT-218ENST00000620394 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 PTGER1P34995 402 aa20.45■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 OR8K3Q8NH51 312 aa20.45■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 FAM57AQ8TBR7 257 aa20.45■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.45■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.45■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 ACOT9Q9Y305 439 aa20.45■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 SYCE1LA8MT33 242 aa20.44■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 TUBB4AP04350 444 aa20.44■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 IFNA16P05015 189 aa20.44■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 EPB42P16452 691 aa20.44■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 SETDB1Q15047 1291 aa20.44■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.44■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 CD163Q86VB7 1156 aa20.44■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 TMEM200AQ86VY9 491 aa20.44■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.44■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.44■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.44■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 RASL10BQ96S79 203 aa20.44■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 DEPPQ9NTK1 212 aa20.44■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 A8MVJ9 347 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 KLK8O60259 260 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 LDB3O75112 727 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 PCNAP12004 261 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 CD99P14209 185 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 PTGS2P35354 604 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 PIK3CBP42338 1070 aa20.43■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 ARFIP1P53367 373 aa20.43■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 STX4Q12846 297 aa20.43■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 CHSY3Q70JA7 882 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 SLC2A12Q8TD20 617 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 ASB15Q8WXK1 588 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 ZNF559Q9BR84 538 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 TMUB1Q9BVT8 246 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 SNX15Q9NRS6 342 aa20.43■□□□□ 0.86
SRRT-218ENST00000620394 HPF1Q9NWY4 346 aa20.43■□□□□ 0.86
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SRRT-218ENST00000620394 ZNF321PQ8N8H1 164 aa20.42■□□□□ 0.86
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