RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616596.4

RDM1-220, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 1,032 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-220ENST00000616596 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 SPACA6W5XKT8 324 aa14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.66□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 GLOD5A6NK44 160 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 PGRMC2O15173 223 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 CTNSO60931 367 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 LDB3O75112 727 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 IL3P08700 152 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 NR2F6P10588 404 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 HSD17B7P56937 341 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 TAS2R50P59544 299 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 ATP1A4Q13733 1029 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 NACC2Q96BF6 587 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 EGLN2Q96KS0 407 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 HEY2Q9UBP5 337 aa14.65□□□□□ -0.06
RDM1-220ENST00000616596 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 A0A1W2PQ72 361 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 BLACEA4D250 179 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 MASP2O00187 686 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 CLDN4O14493 209 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 FGF17O60258 216 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 MYO1DO94832 1006 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 SDC1P18827 310 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 ID2Q02363 134 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 SLC13A2Q13183 592 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 PCOLCEQ15113 449 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 NSDHLQ15738 373 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 AMER2Q8N7J2 671 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 THAP4Q8WY91 577 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 TANKQ92844 425 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 C1orf50Q9BV19 199 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 PRORYQ9H606 182 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 MYNNQ9NPC7 610 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 POLHQ9Y253 713 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.64□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 A0A1W2PS29 197 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 PCDH17O14917 1159 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 GUCY1B2O75343 617 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 COX6A1P12074 109 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 BCKDHAP12694 445 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 ACPPP15309 386 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 PPP2R1BP30154 601 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 FOLH1Q04609 750 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.63□□□□□ -0.07
RDM1-220ENST00000616596 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms