RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 PARPBPQ9NWS1 579 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 WASF3Q9UPY6 502 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 LRRC37A3O60309 1634 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 PCDH17O14917 1159 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 RBBP9O75884 186 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 GDI1P31150 447 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 FADDQ13158 208 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ALG10Q5BKT4 473 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 OR4K14Q8NGD5 310 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 LMO3Q8TAP4 145 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 METTL7AQ9H8H3 244 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CD8B2A6NJW9 211 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 C12orf71A8MTZ7 269 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 LDB2O43679 373 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SLC35E2BP0CK96 405 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CD8BP10966 210 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CDKN2DP55273 166 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 FXYD6P3P58550 94 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ABRAXAS2Q15018 415 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 AVL9Q8NBF6 648 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 TCEAL4Q96EI5 215 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 FAM72CH0Y354 149 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SOCS5O75159 536 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SPARCP09486 303 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 MAGEA11P43364 429 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 LSAMPQ13449 338 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 FAM72BQ86X60 149 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SLC2A13Q96QE2 648 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 FBXL12Q9NXK8 326 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SLC39A1Q9NY26 324 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 B4GALT6Q9UBX8 382 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 MTMR11A4FU01 709 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 C9J4A7 227 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 FBP2O00757 339 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 PLD2O14939 933 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 GNSP15586 552 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CD9P21926 228 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 GKP32189 559 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 HNF1BP35680 557 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SOX2P48431 317 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 MECP2P51608 486 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CRISP1P54107 249 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CEACAM7Q14002 265 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 STEAP4Q687X5 459 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ARSKQ6UWY0 536 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CCDC32Q9BV29 185 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ACTR6Q9GZN1 396 aa11.49□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 LEFTY2O00292 366 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 GRID2O43424 1007 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 RHCEP18577 417 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 RFC2P35250 354 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 NPRL3Q12980 569 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ZNF584Q8IVC4 421 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 OTUB2Q96DC9 234 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SOBPA7XYQ1 873 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 BEST1O76090 585 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 S1PR4O95977 384 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 STSP08842 583 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 S100A12P80511 92 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ID2Q02363 134 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 POU4F2Q12837 409 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SLC36A3Q495N2 470 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 GPAT4Q86UL3 456 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 NUP43Q8NFH3 380 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 PEX13Q92968 403 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 ENY2Q9NPA8 101 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 SMOXQ9NWM0 555 aa11.48□□□□□ -0.57
TNS1-220ENST00000611415 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms