RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	NPAS2	Q99743	824 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF225	Q9UK10	706 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TMPRSS11D	O60235	418 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PDYN	P01213	254 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	KRT6A	P02538	564 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	KRT6B	P04259	564 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	KRT6C	P48668	564 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PKNOX1	P55347	436 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ID2	Q02363	134 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	SLC18A2	Q05940	514 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	C18orf63	Q68DL7	685 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	NCLN	Q969V3	563 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	WDR41	Q9HAD4	459 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	BRF2	Q9HAW0	419 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ASB4	Q9Y574	426 aa		18.73	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	GABRR3	A8MPY1	467 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PROM1	O43490	865 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	FGF17	O60258	216 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MAN1A2	O60476	641 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PRAMEF2	O60811	474 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	NR2F6	P10588	404 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TNNI3	P19429	210 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	HMOX2	P30519	316 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	NAA20	P61599	178 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TUBA3C	Q13748	450 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	INA	Q16352	499 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	METTL4	Q8N3J2	472 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	METTL6	Q8TCB7	284 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MID2	Q9UJV3	735 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TENM4	Q6N022	2769 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MANBA	O00462	879 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CDK2AP1	O14519	115 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	GBA	P04062	536 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	COX7A2	P14406	83 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CPA3	P15088	417 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	GNLY	P22749	145 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	UQCRFS1	P47985	274 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	DNAJB13	P59910	316 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	FOLH1	Q04609	750 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	BIK	Q13323	160 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TRABD2A	Q86V40	505 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MREG	Q8N565	214 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MORN4	Q8NDC4	146 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	GRHL3	Q8TE85	626 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	APOPT1	Q96IL0	206 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	DGAT2	Q96PD7	388 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MKS1	Q9NXB0	559 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1W2PR48	441 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC151	A5D8V7	595 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	C17orf105	B2RV13	164 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	FCHO1	O14526	889 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ULK1	O75385	1050 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	ESRRB	O95718	433 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PSME3-209	ENST00000589469	AIFM1	O95831	613 aa		18.7	■□□□□ 0.58

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