RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A096LPI6	279 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	AXIN1	O15169	862 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	IDH3B	O43837	385 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	KLK1	P06870	262 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	COX7A2	P14406	83 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ATP6V1B2	P21281	511 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TRPC1	P48995	793 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	RAD23A	P54725	363 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	IQCH	Q86VS3	1027 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ITCH	Q96J02	903 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SIAE	Q9HAT2	523 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	MYNN	Q9NPC7	610 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		14.65	□□□□□ -0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ISM1	B1AKI9	464 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	UGT2B11	O75310	529 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CLEC3A	O75596	197 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CSF2	P04141	144 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GSN	P06396	782 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CTSE	P14091	401 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	JUND	P17535	347 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CMPK1	P30085	196 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	BSG	P35613	385 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GRIA3	P42263	894 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	BLK	P51451	505 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	DGUOK	Q16854	277 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PERM1	Q5SV97	790 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TRPV3	Q8NET8	790 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	COQ8B	Q96D53	544 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF639	Q9UID6	485 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	LAMA1	P25391	3075 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MUC3A	Q02505	3323 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A0G2JNG1	304 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OR5K4	A6NMS3	321 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	DYRK3	O43781	588 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CCNDBP1	O95273	360 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	VIP	P01282	170 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HTR1E	P28566	365 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CD40LG	P29965	261 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	IFITM2	Q01629	132 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CHRNE	Q04844	493 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HYAL2	Q12891	473 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PDE7A	Q13946	482 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KIR2DS5	Q14953	304 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZIC1	Q15915	447 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF385B	Q569K4	471 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	IFNE	Q86WN2	208 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	RDH12	Q96NR8	316 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OR2A14	Q96R47	310 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		14.64	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TLR4	O00206	839 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ARPC2	O15144	300 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FURIN	P09958	794 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HRH2	P25021	359 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OR4D2	P58180	307 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MC1R	Q01726	317 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CYP4F3	Q08477	520 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	EPS8	Q12929	822 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KIR2DS3	Q14952	304 aa		14.63	□□□□□ -0.07

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