RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 RMI1Q9H9A7 625 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 WASH6PQ9NQA3 447 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 LHX6Q9UPM6 363 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC160A6NGH7 325 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 E2F6O75461 281 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 CSF2P04141 144 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 HKDC1Q2TB90 917 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF773Q6PK81 442 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 CRTC3Q6UUV7 619 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC30A8Q8IWU4 369 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB42Q8N4Z0 105 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL10Q8N8L6 244 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC24A3Q9HC58 644 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 KLF15Q9UIH9 416 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 BAG5Q9UL15 447 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 APC2O95996 2303 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 FABP3P05413 133 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 FURINP09958 794 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 FPR1P21462 350 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 RYKP34925 604 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 RGNQ15493 299 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SPESP1Q6UW49 350 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM26Q6ZUK4 368 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CLECL1Q8IZS7 167 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf65Q8NCR3 313 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 MUS81Q96NY9 551 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 MBOAT4Q96T53 435 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 KNTC1P50748 2209 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SCAMP1O15126 338 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 NME1P15531 152 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM23P36406 574 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.462e-14■■□□□ 13.1
CAPNS1-204ENST00000587718 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf64Q86WR6 236 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD11Q8NFV4 315 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52N2Q8NGI0 321 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf78Q8WTQ4 265 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SMPDL3AQ92484 453 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 QRFPRQ96P65 431 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 AIF1LQ9BQI0 150 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMM29Q9BSF4 260 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ING2Q9H160 280 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ADPRHL2Q9NX46 363 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 NLGN3Q9NZ94 848 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM9Q9P0T7 183 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ICKQ9UPZ9 632 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BSA7 217 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 YY2O15391 372 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 NOBOXO60393 691 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJB5O75953 348 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CPNE6O95741 557 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CKMT1AP12532 417 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 NELFEP18615 380 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 WSCD2Q2TBF2 565 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ISLR2Q6UXK2 745 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 PARGQ86W56 976 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM181AQ8N9Y4 354 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G15Q8NCC3 412 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SETD9Q8NE22 299 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 PPCDCQ96CD2 204 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM38AQ9H6F2 299 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVK-11Q9UQG0 969 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 U3KQA8 63 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ITPR1Q14643 2758 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 UGT2B11O75310 529 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GALT4O96024 378 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGA1P56199 1179 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBA3CQ13748 450 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 BROXQ5VW32 411 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 C19orf48Q6RUI8 117 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC80Q76M96 950 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 OFCC1Q8IZS5 231 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4A15Q8NGL6 344 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC26Q8NHZ8 85 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 FBLIM1Q8WUP2 373 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGED4Q96JG8 741 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3BP4Q9P0V3 963 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 PCM1Q15154 2024 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT75O95678 551 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF682O95780 498 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH15P55291 814 aa24.16■■□□□ 1.46
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