RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 ITGA8P53708 1063 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TAS2R50P59544 299 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 GPR85P60893 370 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 PPIAP62937 165 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 PLGLB1Q02325 96 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 DSC2Q02487 901 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 FOXO1Q12778 655 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 SLC10A1Q14973 349 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 ETFDHQ16134 617 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 QPCTQ16769 361 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM249Q2WGJ8 235 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 P3H1Q32P28 736 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TTMPQ5BVD1 217 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CLVS2Q5SYC1 327 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 FNBP1LQ5T0N5 605 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 C6orf163Q5TEZ5 329 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 AGBL2Q5U5Z8 902 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 NAA35Q5VZE5 725 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 KANK2Q63ZY3 851 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CYB5R2Q6BCY4 276 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 VASNQ6EMK4 673 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 GJB7Q6PEY0 223 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 WDR59Q6PJI9 974 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 FIGLAQ6QHK4 219 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TREML4Q6UXN2 200 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 UNC5AQ6ZN44 842 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 RGS9BPQ6ZS82 235 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 SEM1Q6ZVN7 128 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TRILQ7L0X0 811 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 KRT74Q7RTS7 529 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 OTOAQ7RTW8 1153 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TMC3Q7Z5M5 1100 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CROCCP2Q86T23 111 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC25Q86WR0 208 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CREG2Q8IUH2 290 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 KIRREL3Q8IZU9 778 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 SLC5A8Q8N695 610 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TEX26Q8N6G2 289 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC17Q8N6Y2 441 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 ANKS4BQ8N8V4 417 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 NAXEQ8NCW5 288 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF540Q8NDQ6 660 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 SPATA4Q8NEY3 305 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 LPCAT1Q8NF37 534 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 OR52E1Q8NGJ3 308 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 OR2L2Q8NH16 312 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CFAP61Q8NHU2 1237 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 ANGPTL6Q8NI99 470 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 JOSD2Q8TAC2 188 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TEX47Q8TBZ9 253 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 M1APQ8TC57 530 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 IGFBPL1Q8WX77 278 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 NELFBQ8WX92 580 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CPA5Q8WXQ8 436 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 HPS1Q92902 700 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 SARAFQ96BY9 339 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 PIK3IP1Q96FE7 263 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CHMP6Q96FZ7 201 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CAPZA3Q96KX2 299 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 ZIM3Q96PE6 472 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 VPS35Q96QK1 796 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CYTH2Q99418 400 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CHP1Q99653 195 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC1Q9BTT6 524 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 HGH1Q9BTY7 390 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 PACSIN1Q9BY11 444 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 GPR63Q9BZJ6 419 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TRIM15Q9C019 465 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 GBA3Q9H227 469 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 DPH5Q9H2P9 285 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 MVB12BQ9H7P6 319 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 UGT1A7Q9HAW7 530 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 UGT1A10Q9HAW8 530 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 UGT1A8Q9HAW9 530 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 TMBIM4Q9HC24 238 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 PCDH9Q9HC56 1237 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 BPIFA1Q9NP55 256 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 MMP25Q9NPA2 562 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 THAP1Q9NVV9 213 aa2.25□□□□□ -2.05
SNORD53-201ENST00000579969 SPHK1Q9NYA1 384 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms