RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564365.5

TRAPPC2L-206, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 1,060 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-206ENST00000564365 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-206ENST00000564365 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 TERTO14746 1132 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 TBX19O60806 448 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 CTNSO60931 367 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PTPN4P29074 926 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 HPCAL1P37235 193 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 STX1BP61266 288 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 BIKQ13323 160 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 ERV3-1Q14264 604 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SHISA5Q8N114 240 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 MIER2Q8N344 545 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 CATSPER2Q96P56 530 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 DPY30Q9C005 99 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 REEP4Q9H6H4 257 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 HEY2Q9UBP5 337 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PCDH17O14917 1159 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 ANKRD28O15084 1053 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PGRMC2O15173 223 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 AKAP10O43572 662 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 JRKO75564 520 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 LRATO95237 230 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 IGHEP01854 428 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 HEXBP07686 556 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 FURINP09958 794 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 FOLR3P41439 243 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 ALDH9A1P49189 494 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 EMP2P54851 167 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 MC1RQ01726 317 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 RHAGQ02094 409 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SLC13A2Q13183 592 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PDE7AQ13946 482 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SQLEQ14534 574 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 MARK4Q96L34 752 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 ZBTB18Q99592 522 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 DPH1Q9BZG8 443 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 C3orf18Q9UK00 162 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 TCFL5Q9UL49 500 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 GLOD5A6NK44 160 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 IDSB3KWA1 339 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 CCDC22O60826 627 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SLC22A3O75751 556 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 GPR75O95800 540 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 RECKO95980 971 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PIK3R1P27986 724 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 BTG2P78543 158 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 CLN3Q13286 438 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 SERTAD2Q14140 314 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 TGIF1Q15583 401 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-206ENST00000564365 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms