RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556343.1

ACTN1-218, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 3

Gene ACTN1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-218ENST00000556343 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 ITGAXP20702 1163 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 IL12AP29459 219 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 GCGRP47871 477 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 NUDT2P50583 147 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 XKP51811 444 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 DGKQP52824 942 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 HSD17B7P56937 341 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 OLR1P78380 273 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 MC1RQ01726 317 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 STX4Q12846 297 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 PDE7AQ13946 482 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 SERTAD2Q14140 314 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 UGT8Q16880 541 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 C1orf189Q5VU69 101 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 REP15Q6BDI9 236 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 PDSS2Q86YH6 399 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 BMPERQ8N8U9 685 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 AMER3Q8N944 861 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 FAM47BQ8NA70 645 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 KLHL29Q96CT2 875 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 TEX37Q96LM6 180 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 LRFN5Q96NI6 719 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 GBP5Q96PP8 586 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 CTRCQ99895 268 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 ACTL8Q9H568 366 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 C14orf105Q9NVL8 296 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 TRPC4Q9UBN4 977 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 CROTQ9UKG9 612 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 VPS4AQ9UN37 437 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 A0A096LPI6 279 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 EVPLLA8MZ36 301 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 C4orf51C9J302 202 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 MEN1O00255 615 aa8.69□□□□□ -1.02
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ACTN1-218ENST00000556343 DYRK3O43781 588 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 B4GALT2O60909 372 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 GPR75O95800 540 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 ONECUT2O95948 504 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 NTRK1P04629 796 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 CYC1P08574 325 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 LAMP1P11279 417 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 CAPN3P20807 821 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 PPIBP23284 216 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 GPC1P35052 558 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 XCR1P46094 333 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 OR1D4P47884 311 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 CPA2P48052 419 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 PDX1P52945 283 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 SHC2P98077 582 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 SLC13A2Q13183 592 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 MLC1Q15049 377 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 TLR1Q15399 786 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 C18orf63Q68DL7 685 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 MED25Q71SY5 747 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 DPP10Q8N608 796 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 OR4A15Q8NGL6 344 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 VPS33AQ96AX1 596 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 FKBP10Q96AY3 582 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 MIEF2Q96C03 454 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTN1-218ENST00000556343 RCN3Q96D15 328 aa8.69□□□□□ -1.02
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