RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	CPA3	P15088	417 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CHN1	P15882	459 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CREB1	P16220	341 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TNFSF10	P50591	281 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR143	P51810	404 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ARFIP1	P53367	373 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	NAGLU	P54802	743 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	LCP2	Q13094	533 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TLR1	Q15399	786 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC153	Q494R4	210 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	IQCK	Q8N0W5	287 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	BANP	Q8N9N5	519 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	AGAP11	Q8TF27	550 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBTB9	Q96C00	473 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF32	Q9H0A6	362 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MKS1	Q9NXB0	559 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MAP10	Q9P2G4	905 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PHF11	Q9UIL8	331 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SNX6	Q9UNH7	406 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PLLP	Q9Y342	182 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TIMM22	Q9Y584	194 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SPACA6	W5XKT8	324 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	POLE	Q07864	2286 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PS29	197 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	OR5H15	A6NDH6	313 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SPAG7	O75391	227 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MLYCD	O95822	493 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	AIFM1	O95831	613 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CD96	P40200	585 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	UQCRFS1	P47985	274 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	FOXA1	P55317	472 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PKNOX1	P55347	436 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAJB13	P59910	316 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNC4	Q03721	635 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	FOLH1	Q04609	750 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF844	Q08AG5	666 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	STX4	Q12846	297 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PCLAF	Q15004	111 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TERF2	Q15554	542 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MEP1A	Q16819	746 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	NUDT13	Q86X67	352 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	METTL4	Q8N3J2	472 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC5A8	Q8N695	610 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC63	Q8NA47	563 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	RDH11	Q8TC12	318 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	METTL6	Q8TCB7	284 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	DOK4	Q8TEW6	326 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	NCLN	Q969V3	563 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC126	Q96EE4	140 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	APOPT1	Q96IL0	206 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ACPT	Q9BZG2	426 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CLMP	Q9H6B4	373 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	BRF2	Q9HAW0	419 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	OXSM	Q9NWU1	459 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		10.48	□□□□□ -0.73

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