RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TXNDC16Q9P2K2 825 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NARFQ9UHQ1 456 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHA7Q9UN72 937 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NME7Q9Y5B8 376 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZHX2Q9Y6X8 837 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa3.33□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1W2PPQ1 181 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1W2PS29 197 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM89A2RUT3 159 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKUB1A6NFN9 424 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CBY3A6NI87 242 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SNTNA6NMZ2 147 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 BTBD19C9JJ37 291 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 E7ENQ6 273 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TULP2O00295 520 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TOR1AO14656 332 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KLF11O14901 512 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 COCHO43405 550 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIAP1O43715 76 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SSX4O60224 188 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TPST2O60704 377 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 STC2O76061 302 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SYNGR4O95473 234 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NSA2O95478 260 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ACSL3O95573 720 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPAN12O95859 305 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ASS1P00966 412 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IL6P05231 212 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 APRTP07741 180 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ANXA5P08758 320 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CD22P20273 847 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NR4A1P22736 598 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GCSHP23434 173 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GIFP27352 417 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMB6P28072 239 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TYK2P29597 1187 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HMOX2P30519 316 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OXTRP30559 389 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GABRA5P31644 462 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CASP14P31944 242 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR1D2P34982 312 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FEN1P39748 380 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CDKN2CP42773 168 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TNFRSF4P43489 277 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC6A8P48029 635 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ADPRHP54922 357 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNK10P57789 538 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PPP2R2BQ00005 443 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GUCY1B3Q02153 619 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 BDH1Q02338 343 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MBTD1Q05BQ5 628 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC3A1Q07837 685 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CDH17Q12864 832 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ITGADQ13349 1161 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CUL3Q13618 768 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GRB14Q14449 540 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GANABQ14697 944 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ME3Q16798 604 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MEP1AQ16819 746 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM46CQ5VWP2 391 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 WSCD1Q658N2 575 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MFSD12Q6NUT3 480 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DOK6Q6PKX4 331 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IL17RELQ6ZVW7 336 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SCD5Q86SK9 330 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC190Q86UF4 302 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SATL1Q86VE3 508 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC22A16Q86VW1 577 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CBWD2Q8IUF1 395 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LCORLQ8N3X6 602 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LIX1Q8N485 282 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC44A5Q8NCS7 719 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TTLQ8NG68 377 aa3.32□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms