RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529863.1

NUP160-208, Transcript of nucleoporin 160, human

TSL 5

Gene NUP160, Length 348 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP160-208	ENST00000529863	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	C17orf105	B2RV13	164 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	SYT5	O00445	386 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PROM1	O43490	865 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ATP6AP2	O75787	350 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	SCEL	O95171	688 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	IGKV3-11	P04433	115 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863		P04436	131 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	GDF5	P43026	501 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	KIR2DL3	P43628	341 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	KCNC1	P48547	511 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	STX4	Q12846	297 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	TGFBI	Q15582	683 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ZNF721	Q8TF20	911 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	KCNC2	Q96PR1	638 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	LIME1	Q9H400	295 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863		A6NNC1	897 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	HSPB2	A8KAH6	182 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PRAMEF4	O60810	478 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ETHE1	O95571	254 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	DNASE1	P24855	282 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	GGT5	P36269	586 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ASCL1	P50553	236 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	TGM3	Q08188	693 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	E2F2	Q14209	437 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ZNF460	Q14592	562 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PPP1R7	Q15435	360 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	HSPB2	Q16082	182 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PIGG	Q5H8A4	983 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	CDC20B	Q86Y33	519 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	FAM222B	Q8WU58	562 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	LDAH	Q9H6V9	325 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	PSAT1	Q9Y617	370 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	LDB3	O75112	727 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	DRD2	P14416	443 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	CD22	P20273	847 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	IVD	P26440	423 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ELK3	P41970	407 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	TAS2R39	P59534	338 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ADAM8	P78325	824 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	ASPH	Q12797	758 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NUP160-208	ENST00000529863	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.67	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms