RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	FOXL1	Q12952	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OLIG2	Q13516	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	GRB7	Q14451	532 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM205	Q6UW68	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	NRGN	Q92686	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ANK2	Q01484	3957 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	IDS	B3KWA1	339 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CCL22	O00626	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ASNA1	O43681	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CST8	O60676	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ANXA9	O76027	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MLYCD	O95822	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ICAM2	P13598	275 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	EGR1	P18146	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CHRM3	P20309	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CXCR2	P25025	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PSMA3	P25788	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SLC26A3	P40879	764 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	EMP2	P54851	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	GEM	P55040	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	AP2B1	P63010	937 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MESD	Q14696	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	STX1A	Q16623	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	AMER3	Q8N944	861 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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