RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 CHFRQ96EP1 664 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 GHITMQ9H3K2 345 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 RDH8Q9NYR8 311 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 COPS3Q9UNS2 423 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 FABP12A6NFH5 140 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 CACNG3O60359 315 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 PAMP19021 973 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 SOX3P41225 446 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ERVK-8P63133 956 aa9.65□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.65□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 XKR7Q5GH72 579 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRG3Q86Y34 549 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 STX19Q8N4C7 294 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 OR6M1Q8NGM8 313 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 SORCS1Q8WY21 1168 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 PHF21AQ96BD5 680 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 MGLLQ99685 303 aa9.65□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TREX1Q9NSU2 369 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 SPASTQ9UBP0 616 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 MALT1Q9UDY8 824 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 NPPAP01160 153 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 CD1DP15813 335 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 NFKB2Q00653 900 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 FAM209BQ5JX69 171 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZSR9 355 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 RNF130Q86XS8 419 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.65□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 OR2T5Q6IEZ7 315 aa9.65□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 OR8K3Q8NH51 312 aa9.65□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 OPALINQ96PE5 141 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 C12orf57Q99622 126 aa9.65□□□□□ -0.87
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TRPS1-211ENST00000520276 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CMAHPQ9Y471 501 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0D9SEW6 157 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 OR1I1O60431 355 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MAP2K3P46734 347 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 IDH2P48735 452 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 AKR1D1P51857 326 aa9.64□□□□□ -0.87
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