RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516209.1

RNU2-30P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 30, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-30P, Length 141 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-30P-201ENST00000516209 SLC35G4P0C7Q5 338 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 RALBP11234 206 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 F3P13726 295 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 BRAFP15056 766 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 VCLP18206 1134 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 IDSP22304 550 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 ASMTP46597 345 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NPY2RP49146 381 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 PRLHRP49683 370 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 DIO1P49895 249 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 CLCNKAP51800 687 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 ITGA8P53708 1063 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 CDK16Q00536 496 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 ACVR1Q04771 509 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 GPR33Q49SQ1 333 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 BCL7AQ4VC05 210 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 SYTL3Q4VX76 610 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 LRRC8BQ6P9F7 803 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 AMZ2Q86W34 360 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 SFRP1Q8N474 314 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 ARL14Q8N4G2 192 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 OR4L1Q8NH43 312 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 FAM76AQ8TAV0 307 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 HM13Q8TCT9 377 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 ELMO1Q92556 727 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 SLCO2A1Q92959 643 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 CXorf40BQ96DE9 158 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 COG8Q96MW5 612 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NRTNQ99748 197 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 HGH1Q9BTY7 390 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 CCDC68Q9H2F9 335 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 LRRN3Q9H3W5 708 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 COG4Q9H9E3 785 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 RDH14Q9HBH5 336 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 TREX1Q9NSU2 369 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 IL20Q9NYY1 176 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 TMEM9Q9P0T7 183 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 PCYOX1Q9UHG3 505 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 SNX24Q9Y343 169 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 KNL1Q8NG31 2342 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 CACNA1GO43497 2377 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 RP1P56715 2156 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 ATRXP46100 2492 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 CHD6Q8TD26 2715 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 A0A0G2JNG1 304 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 KRT87PA6NCN2 255 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 MGAT4DA6NG13 374 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 AGAP14A8MT82 685 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 IQCF5A8MTL0 148 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 A8MU76 341 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 GPR89AB7ZAQ6 455 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 B4GAT1O43505 415 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 TMPRSS11DO60235 418 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NIPSNAP2O75323 286 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 NDUFS3O75489 264 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 PAHP00439 452 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 VIPP01282 170 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 APOA4P06727 396 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 GP1BAP07359 652 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU2-30P-201ENST00000516209 GPR89BP0CG08 455 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms