RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513789.1

ZFYVE16-213, Transcript of zinc finger FYVE-type containing 16, human

TSL 3

Gene ZFYVE16, Length 423 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZFYVE16-213	ENST00000513789	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	NEDD4	P46934	1319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	MCF2L	O15068	1137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	ANGPT2	O15123	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SURF4	O15260	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	GRAP2	O75791	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	KRT6B	P04259	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CTNNA2	P26232	953 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	KRT6C	P48668	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	HNMT	P50135	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SST	P61278	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	BTG1	P62324	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SPP2	Q13103	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	KRT31	Q15323	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	HAS2	Q92819	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SSX3	Q99909	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	MED20	Q9H944	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789		M0R296	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	ECE2	O60344	883 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	GMNN	O75496	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	MYOG	P15173	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	PRKACG	P22612	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	AKT2	P31751	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	HSPA1L	P34931	641 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SLC1A3	P43003	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	PITPNB	P48739	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CLCN4	P51793	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	ARFIP1	P53367	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	GIT2	Q14161	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CARTPT	Q16568	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SEPT8	Q92599	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	ESAM	Q96AP7	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789		A0A087WZY1	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789		H0YCG3	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CHUK	O15111	745 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	LRCH4	O75427	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CLN5	O75503	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	CHRNG	P07510	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	SFTPB	P07988	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	PRG2	P13727	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	C4BPB	P20851	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	TRPC1	P48995	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	TNFSF10	P50591	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	MTTP	P55157	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZFYVE16-213	ENST00000513789	KCNK10	P57789	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms