RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		7.71	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OR51A7	Q8NH64	312 aa		7.71	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT8	Q8WV74	236 aa		7.71	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM19	Q96HH6	336 aa		7.71	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		7.71	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	BRD7	Q9NPI1	651 aa		7.71	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		7.71	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		7.71	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PROM1	O43490	865 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	REM1	O75628	298 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CCL5	P13501	91 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CRHBP	P24387	322 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PCSK6	P29122	969 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	BMP8B	P34820	402 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PGF	P49763	221 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PRMT2	P55345	433 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	AP3S2	P59780	193 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GPM6B	Q13491	265 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ALG11	Q2TAA5	492 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF613	Q6PF04	617 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OR8H3	Q8N146	312 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP90	Q8TF47	636 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TEX37	Q96LM6	180 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GPR78	Q96P69	363 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	NDC1	Q9BTX1	674 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CREBZF	Q9NS37	354 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	MED31	Q9Y3C7	131 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	FKBP7	Q9Y680	259 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	LAT	O43561	262 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	B4GALT2	O60909	372 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ENTPD6	O75354	484 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	RAB36	O95755	333 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF3	P17036	446 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SYN1	P17600	705 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	FSHR	P23945	695 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ARFIP1	P53367	373 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OR12D2	P58182	307 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SLAMF1	Q13291	335 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	RAB33A	Q14088	237 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PROX2	Q3B8N5	592 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OR2T11	Q8NH01	316 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ISL2	Q96A47	359 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF583	Q96ND8	569 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GPER1	Q99527	375 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SLC38A3	Q99624	504 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	DKK3	Q9UBP4	350 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		7.71	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPK0	400 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CLCA1	A8K7I4	914 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	FAAH	O00519	579 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	EDNRA	P25101	427 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GNAL	P38405	381 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	DSG2	Q14126	1118 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GRM2	Q14416	872 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18

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