RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 BCHEP06276 602 aa25.77■■□□□ 1.72
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SH3BP2-221ENST00000511747 RPS19P39019 145 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-221ENST00000511747 SOX3P41225 446 aa25.77■■□□□ 1.72
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SH3BP2-221ENST00000511747 GPR32P1Q8NGA4 272 aa25.76■■□□□ 1.71
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SH3BP2-221ENST00000511747 NEURL3Q96EH8 262 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 H3BN98 237 aa25.75■■□□□ 1.71
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SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM19Q96HH6 336 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 IL17FQ96PD4 163 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 BARHL1Q9BZE3 327 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 ZBP1Q9H171 429 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 DYRK4Q9NR20 520 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
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SH3BP2-221ENST00000511747 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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SH3BP2-221ENST00000511747 AGAP4Q96P64 663 aa25.74■■□□□ 1.71
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SH3BP2-221ENST00000511747 DDCP20711 480 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 NCF4Q15080 339 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 SLX4IPQ5VYV7 408 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 SAXO2Q658L1 398 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-221ENST00000511747 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
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