RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511237.5

SH3BP2-219, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 517 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-219ENST00000511237 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 TIMP3P35625 211 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 TRPC1P48995 793 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 ZNF75DP51815 510 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SERTAD2Q14140 314 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 MPEG1Q2M385 716 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 PIGGQ5H8A4 983 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 P3H2Q8IVL5 708 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 NAXEQ8NCW5 288 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 MCUQ8NE86 351 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 KIAA1191Q96A73 305 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SERPINB12Q96P63 405 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SERINC2Q96SA4 455 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 AICDAQ9GZX7 198 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CLCA1A8K7I4 914 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CYR61O00622 381 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CES2O00748 559 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 GOSR1O95249 250 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 AHSGP02765 367 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 GNAZP19086 355 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CD53P19397 219 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 PCSK6P29122 969 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 LIM2P55344 173 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 WNT3P56703 355 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 LACC1Q8IV20 430 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 KRT78Q8N1N4 520 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 DAPP1Q9UN19 280 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 VWA7Q9Y334 891 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 COX7A2P14406 83 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 GABRB3P28472 473 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 MTTPP55157 894 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 TGM3Q08188 693 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 POU4F3Q15319 338 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 FAM13CQ8NE31 585 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 OR2L5Q8NG80 312 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 QRFPRQ96P65 431 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CSF3RQ99062 836 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 EGFL8Q99944 293 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CNIH4Q9P003 139 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 VPS13CQ709C8 3753 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CASKO14936 926 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 DYRK3O43781 588 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 LDB3O75112 727 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CLEC3AO75596 197 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 TRAPPC6AO75865 159 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CERS1P27544 350 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 GSTM2P28161 218 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 OPRM1P35372 400 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 PPP2R2BQ00005 443 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 DUSP8Q13202 625 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SLC15A4Q8N697 577 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 TIMP4Q99727 224 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 SPACA6W5XKT8 324 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-219ENST00000511237 WDR47O94967 919 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-219ENST00000511237 ETHE1O95571 254 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-219ENST00000511237 CCDC175P0C221 793 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-219ENST00000511237 PGAM1P18669 254 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-219ENST00000511237 CTSSP25774 331 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-219ENST00000511237 GDF1P27539 372 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-219ENST00000511237 SERPINB3P29508 390 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms