RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPA3	P15088	417 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPN2	P22792	545 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARFIP1	P53367	373 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSD17B7	P56937	341 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	IFT88	Q13099	833 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MFAP5	Q13361	173 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	C18orf63	Q68DL7	685 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC63	Q8NA47	563 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRR7	Q8TB68	274 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	M1AP	Q8TC57	530 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	UCN3	Q969E3	161 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	APOPT1	Q96IL0	206 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCNA7	Q96RP8	456 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	LMF1	Q96S06	567 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	HBEGF	Q99075	208 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERPINI1	Q99574	410 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CENPK	Q9BS16	269 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCNK13	Q9HB14	408 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	OXSM	Q9NWU1	459 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MKS1	Q9NXB0	559 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLLP	Q9Y342	182 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		14.82	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZFHX3	Q15911	3703 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325		A8MUI8	341 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MANBA	O00462	879 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	DDAH2	O95865	285 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	F10	P00742	488 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	LDLR	P01130	860 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	HTR6	P50406	440 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAGLU	P54802	743 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNAJB13	P59910	316 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ID2	Q02363	134 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF844	Q08AG5	666 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	RCN2	Q14257	317 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	EXT1	Q16394	746 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325		Q6ZS92	163 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPR180	Q86V85	440 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	RDH11	Q8TC12	318 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC126	Q96EE4	140 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	NPAS2	Q99743	824 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MMP25	Q9NPA2	562 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SNX6	Q9UNH7	406 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ASB4	Q9Y574	426 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	TIMM22	Q9Y584	194 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		14.81	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PROM1	O43490	865 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAN1A2	O60476	641 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYO1D	O94832	1006 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEMA3D	O95025	777 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MLYCD	O95822	493 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	TUBB	P07437	444 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHN1	P15882	459 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	FOXA1	P55317	472 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	LCP2	Q13094	533 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCLAF	Q15004	111 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRT71	Q3SY84	523 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	CUZD1	Q86UP6	607 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	IQCK	Q8N0W5	287 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	METTL4	Q8N3J2	472 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	METTL6	Q8TCB7	284 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ELP5	Q8TE02	316 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	AGAP11	Q8TF27	550 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	TM9SF4	Q92544	642 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZIM3	Q96PE6	472 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		14.8	□□□□□ -0.04
PRKCZ-222	ENST00000496325	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		14.8	□□□□□ -0.04

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