RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 PTOV1Q86YD1 416 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MBOAT4Q96T53 435 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LGR4Q9BXB1 951 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RAB23Q9ULC3 237 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IGLON5A6NGN9 336 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TNFSF14O43557 240 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 UGDHO60701 494 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KLK1P06870 262 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PPP2R2BQ00005 443 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CD47Q08722 323 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C2orf80Q0P641 193 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ST3GAL2Q16842 350 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NAGSQ8N159 534 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ISOC1Q96CN7 298 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RAB33BQ9H082 229 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FANCEQ9HB96 536 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C8orf4Q9NR00 106 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IFT52Q9Y366 437 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 A0A0G2JN53 185 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PIPSLA2A3N6 862 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 H0YAE9 185 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 XPNPEP2O43895 674 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CCNDBP1O95273 360 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C6orf47O95873 294 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 STATHP02808 62 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ETFAP13804 333 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IDSP22304 550 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.346e-6■■□□□ 11.4
HERC4-211ENST00000492996 NR4A2P43354 598 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1024LP59773 190 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IL5RAQ01344 420 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DMWDQ09019 674 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZBED5Q49AG3 693 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TTC23Q5W5X9 447 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BORAQ6PGQ7 559 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CHPFQ8IZ52 775 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CITED4Q96RK1 184 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RUBCNLQ9H714 662 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR1A2Q9Y585 309 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPW3 197 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GPX2P18283 190 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PSMB5P28074 263 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EPHA2P29317 976 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SOAT1P35610 550 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HPCAL1P37235 193 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FNTBP49356 437 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NXPH1P58417 271 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R50P59544 299 aa6.68□□□□□ -1.34
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