RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	BEST3	Q8N1M1	668 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PGM2	Q96G03	612 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NPAS2	Q99743	824 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		16.16	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	C4orf51	C9J302	202 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CYR61	O00622	381 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	FCHO1	O14526	889 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CTNS	O60931	367 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SBK3	P0C264	359 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF224	P0DH78	156 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CLCN2	P51788	898 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MLF1	P58340	268 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJB13	P59910	316 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	OLR1	P78380	273 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	BTG2	P78543	158 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CLC	Q05315	142 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	RBPJ	Q06330	500 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	IFT88	Q13099	833 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SERTAD2	Q14140	314 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	HDX	Q7Z353	690 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SHISA5	Q8N114	240 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC34A3	Q8N130	599 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	OR7G3	Q8NG95	312 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MS4A8	Q9BY19	250 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PPT2	Q9UMR5	302 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX6	Q9UNH7	406 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRR3	A8MPY1	467 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YIV9	168 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SPAG7	O75391	227 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GALT4	O96024	378 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SP1	P08047	785 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CD22	P20273	847 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CYB561	P49447	251 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	HLCS	P50747	726 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR143	P51810	404 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	LIM2	P55344	173 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PKNOX1	P55347	436 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CASP8	Q14790	479 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1C1	Q15619	314 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	LIPM	Q5VYY2	423 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MORN4	Q8NDC4	146 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8K3	Q8NH51	312 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	VMP1	Q96GC9	406 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OXSM	Q9NWU1	459 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	EMCN	Q9ULC0	261 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SPACA6	W5XKT8	324 aa		16.14	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM227A	F5H4B4	570 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424		G3V2L1	256 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR7A17	O14581	309 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRTM2	O43300	516 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CRCP	O75575	148 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NEURL1	O76050	574 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MAOA	P21397	527 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RAP1GDS1	P52306	607 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G16	P53816	162 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NAGLU	P54802	743 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH13	P55290	713 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	LCP2	Q13094	533 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		16.13	■□□□□ 0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	UNC50	Q53HI1	259 aa		16.13	■□□□□ 0.17

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