RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 REEP4Q9H6H4 257 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 APMAPQ9HDC9 416 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SAR1AQ9NR31 198 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 C14orf105Q9NVL8 296 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 KCMF1Q9P0J7 381 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ACSL6Q9UKU0 697 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SATB2Q9UPW6 733 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 FAM234BA2RU67 622 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SGK494L7N484 410 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MEN1O00255 615 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 FCHO1O14526 889 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD28O15084 1053 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CHST10O43529 356 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS11DO60235 418 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 STATHP02808 62 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 IL6P05231 212 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 NR2F6P10588 404 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ITIH1P19827 911 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 DDCP20711 480 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 GPX3P22352 226 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CPN2P22792 545 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PRDX6P30041 224 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 HSD17B7P56937 341 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TNFRSF17Q02223 184 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 C2orf80Q0P641 193 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PDE7AQ13946 482 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 RUNX2Q13950 521 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 C3orf38Q5JPI3 329 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TMEM198Q66K66 360 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 OVCH1Q7RTY7 1134 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 RIMKLAQ8IXN7 391 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CA13Q8N1Q1 262 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ESX1Q8N693 406 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 VPS37AQ8NEZ2 397 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 DNAJB8Q8NHS0 232 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D20Q96BZ9 403 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SLC46A1Q96NT5 459 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SPRY4Q9C004 299 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 WDR54Q9H977 334 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 GIMAP2Q9UG22 337 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MMACHCQ9Y4U1 282 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CAPN7Q9Y6W3 813 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 A0A0G2JN53 185 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 C9J4A7 227 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 RDH16O75452 317 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 STK17BO94768 372 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0754O94854 1291 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TNFSF15O95150 251 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MED26O95402 600 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TIAF1O95411 115 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 DLGAP3O95886 979 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 IL3P08700 152 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TACR1P25103 407 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ETV5P41161 510 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 OCA2Q04671 838 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 VAC14Q08AM6 782 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TERF2Q15554 542 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ANXA8L1Q5VT79 327 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SLC48A1Q6P1K1 146 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PRSS41Q7RTY9 318 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 AMER3Q8N944 861 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 OR8J2Q8NGG1 315 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 OR51Q1Q8NH59 317 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TTC9Q92623 222 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 COQ8BQ96D53 544 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TSSK3Q96PN8 268 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CTRCQ99895 268 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A23Q9BV35 468 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 EBPLQ9BY08 206 aa11.03□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms