RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 NCK1P16333 377 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 DHFR2Q86XF0 187 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 NATD1Q8N6N6 113 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 ZFP90Q8TF47 636 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 PHF11Q9UIL8 331 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 I3L1I5 382 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 C8orf89P0DMQ9 161 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 DDX5P17844 614 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 HTR1EP28566 365 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 GZMMP51124 257 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 NUBP1P53384 320 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 TNFRSF17Q02223 184 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 BNIP2Q12982 314 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 LYRM4Q9HD34 91 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 EVPLLA8MZ36 301 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM150CB9EJG8 249 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 FOXS1O43638 330 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 RDH16O75452 317 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 NELFEP18615 380 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 ATP6V1B2P21281 511 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 HSPB3Q12988 150 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 TCTE1Q5JU00 501 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 OR2T12Q8NG77 320 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 OR5AK3PQ8NH89 298 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 OR5P2Q8WZ92 322 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 JADE3Q92613 823 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 SLC35A5Q9BS91 424 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 GLIPR2Q9H4G4 154 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 CXorf36Q9H7Y0 433 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 DCLRE1BQ9H816 532 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 ACSL6Q9UKU0 697 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXB3-207ENST00000472863 H3BMH7 237 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 ARPC2O15144 300 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF883P0CG24 379 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 DUSP2Q05923 314 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 RCN1Q15293 331 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 DBX2Q6ZNG2 339 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 SPATA24Q86W54 205 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 CALHM3Q86XJ0 350 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 CA13Q8N1Q1 262 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 SNX8Q9Y5X2 465 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 FAM227AF5H4B4 570 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 GPX2P18283 190 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 FEN1P39748 380 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 CASP9P55211 416 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 SNCBQ16143 134 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 NDUFA9Q16795 377 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 GPR155Q7Z3F1 870 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 SPPL2CQ8IUH8 684 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 AMDHD1Q96NU7 426 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 BBS4Q96RK4 519 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 MS4A12Q9NXJ0 267 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 ACTR3BQ9P1U1 418 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 PRDM4Q9UKN5 801 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 FITM1A5D6W6 292 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 AGRPO00253 132 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 OR2B3O76000 313 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 PTGER1P34995 402 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 FXNQ16595 210 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 KMT5CQ86Y97 462 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 CCDC116Q8IYX3 515 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 RCBTB1Q8NDN9 531 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 S100A14Q9HCY8 104 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 GPATCH2Q9NW75 528 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 BCAP29Q9UHQ4 241 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 AP3M1Q9Y2T2 418 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 CYR61O00622 381 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 SOAT1P35610 550 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 GRK6P43250 576 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 CDK9P50750 372 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 SHC2P98077 582 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 OR4N5Q8IXE1 308 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 TRIML2Q8N7C3 387 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 SUMF1Q8NBK3 374 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM52Q8NDY8 209 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 OR4D9Q8NGE8 314 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB3-207ENST00000472863 OR1L3Q8NH93 324 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms