RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470563.5

RBM39-227, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 3

Gene RBM39, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-227	ENST00000470563	NDC80	O14777	642 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PGRMC2	O15173	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NTN1	O95631	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LIF	P15018	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FER	P16591	822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MSH3	P20585	1137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CASP1	P29466	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CHRNA3	P32297	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	STARD6	P59095	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RPA4	Q13156	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TAF13	Q15543	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RBBP7	Q16576	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PIGB	Q92521	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KRT35	Q92764	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563		A0A1W2PRV1	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CETN3	O15182	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZBTB14	O43829	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PRDM1	O75626	825 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NEBL	O76041	1014 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	DDHD2	O94830	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	BAG3	O95817	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MT-ND3	P03897	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GSTA2	P09210	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	DGKA	P23743	735 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GCK	P35557	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NPBWR1	P48145	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZNF132	P52740	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SLC18A1	P54219	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GSTO1	P78417	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CAV1	Q03135	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	IL10RB	Q08334	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	STXBP2	Q15833	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	VCX	Q9H320	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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