RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 LINC01565O15544 149 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ITGA10O75578 1167 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ALDH3A2P51648 485 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 HK3P52790 923 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ARSFP54793 590 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 VPS26BQ4G0F5 336 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 XKR5Q6UX68 686 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 LIPIQ6XZB0 460 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FAM129CQ86XR2 697 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ASB11Q8WXH4 323 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 GATA6Q92908 595 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 B8ZZF3 427 aa7.34□□□□□ -1.24
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USP54-210ENST00000466048 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 PRR35P0CG20 571 aa7.34□□□□□ -1.24
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USP54-210ENST00000466048 HSD3B1P14060 373 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 ACPPP15309 386 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 PRKACAP17612 351 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 MAGP20916 626 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 ALAS2P22557 587 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 HSD3B2P26439 372 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 PRLHRP49683 370 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 BCL7AQ4VC05 210 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 SFT2D3Q587I9 215 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 LIPJQ5W064 366 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 ASB12Q8WXK4 309 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 ZUFSPQ96AP4 578 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 C1orf109Q9NX04 203 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.34□□□□□ -1.24
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USP54-210ENST00000466048 DPTQ07507 201 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 CAMK1Q14012 370 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.33□□□□□ -1.24
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USP54-210ENST00000466048 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 NELL1Q92832 810 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 ALG2Q9H553 416 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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USP54-210ENST00000466048 UPB1Q9UBR1 384 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 TMEM221A6NGB7 291 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 M0R296 226 aa7.33□□□□□ -1.24
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USP54-210ENST00000466048 OR7A10O76100 309 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 SLCO2B1O94956 709 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 EGFP01133 1207 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 GSTT2BP0CG30 244 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 JUPP14923 745 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 CCR7P32248 378 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 CCNIQ14094 377 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 GBX1Q14549 363 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 Q6ZSR6 202 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 TMEM17Q86X19 198 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 PJA1Q8NG27 643 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.33□□□□□ -1.24
USP54-210ENST00000466048 COL26A1Q96A83 441 aa7.33□□□□□ -1.24
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