RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 PRSS44E7EML9 344 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 E9PBE3 544 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 SLCO1B7G3V0H7 640 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 H3BMM5 538 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 H3BQF6 201 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 CHADO15335 359 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 CHMP2AO43633 222 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 SCO2O43819 266 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 SERPINI2O75830 405 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 DDNO94850 711 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 SFTPBP07988 381 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 SERPINF2P08697 491 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 KRT16P08779 473 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 MPZP25189 248 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 HTR2AP28223 471 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 PTPN4P29074 926 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-205ENST00000460278 TNFSF8P32971 234 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 NUDT1P36639 197 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 AVPR1AP37288 418 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 AVPR1BP47901 424 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 GSSP48637 474 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 CCNG1P51959 295 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 P2RX3P56373 397 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 RAB4BP61018 213 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 PSMC5P62195 406 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 RELAQ04206 551 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-205ENST00000460278 PRKAA1Q13131 559 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 STX3Q13277 289 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 XRCC4Q13426 336 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 HERC3Q15034 1050 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 PON2Q15165 354 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 RBBP7Q16576 425 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 MAPK6Q16659 721 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 C9orf50Q5SZB4 431 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM46CQ5VWP2 391 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 WBP2NLQ6ICG8 309 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRC8BQ6P9F7 803 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 CES3Q6UWW8 571 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-205ENST00000460278 ASPGQ86U10 573 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 ITIH5Q86UX2 942 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 LAX1Q8IWV1 398 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-205ENST00000460278 BBS5Q8N3I7 341 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 CERS5Q8N5B7 392 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 OR2T34Q8NGX1 318 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC107Q8WV48 283 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-205ENST00000460278 FCGR1BQ92637 280 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 GGHQ92820 318 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-205ENST00000460278 ULK4Q96C45 1275 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-205ENST00000460278 PGM2Q96G03 612 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-205ENST00000460278 OPALINQ96PE5 141 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 PSD2Q9BQI7 771 aa3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-205ENST00000460278 TIPINQ9BVW5 301 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 CDK19Q9BWU1 502 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 PRRG4Q9BZD6 226 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 TM6SF1Q9BZW5 370 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 PKIBQ9C010 78 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 OR51B5Q9H339 312 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 C10orf88Q9H8K7 445 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 VIPAS39Q9H9C1 493 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 MMP25Q9NPA2 562 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 LZTFL1Q9NQ48 299 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-205ENST00000460278 NUDT15Q9NV35 164 aa3.21□□□□□ -1.9
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