RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB43Q86YS6 212 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TWIST2Q8WVJ9 160 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 IP6K3Q96PC2 410 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SORT1Q99523 831 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CRB3Q9BUF7 120 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 PHF11Q9UIL8 331 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 C3orf18Q9UK00 162 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0A6YYD5 115 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM233B4DJY2 109 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 NKX2-8O15522 239 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 RGS14O43566 566 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 HEXBP07686 556 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 UMODP07911 640 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM87AP0C7U9 286 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 NCALDP61601 193 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 HMGCS1Q01581 520 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ERV3-1Q14264 604 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 GALNTL6Q49A17 601 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 AGR3Q8TD06 166 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS50Q96JG6 964 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 BLACEA4D250 179 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC14CA4D256 554 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 IDSB3KWA1 339 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CLDN4O14493 209 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 KLK1P06870 262 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 PRPH2P23942 346 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MMP11P24347 488 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ACSM2AQ08AH3 577 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC20Q12834 499 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ACSM2BQ68CK6 577 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 COMMD6Q7Z4G1 85 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR180Q86V85 440 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 DDIASQ8IXT1 998 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 PLPP5Q8NEB5 264 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 THAP4Q8WY91 577 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 LANCL2Q9NS86 450 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM227AF5H4B4 570 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CYR61O00622 381 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SUV39H1O43463 412 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 DIAPH2O60879 1101 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 B4GALT2O60909 372 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 GUCY1B2O75343 617 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 JRKO75564 520 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00032P0C843 101 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKAR1AP10644 381 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CPN2P22792 545 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 OTX2P32243 289 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXL2P58012 376 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 BTKQ06187 659 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 IL10RAQ13651 578 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 BORAQ6PGQ7 559 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC34Q8IZ02 419 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL21AQ8WXB1 218 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 APIPQ96GX9 242 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CATSPER2Q96P56 530 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 YIPF3Q9GZM5 350 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf109Q9NX04 203 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms