RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 CLCQ05315 142 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 IFT88Q13099 833 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TUBA3CQ13748 450 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 SERTAD2Q14140 314 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 RASA2Q15283 850 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF678Q5SXM1 525 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 LETMD1Q6P1Q0 360 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 GPR180Q86V85 440 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ZGRF1Q86YA3 2104 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 BCORP1Q8N888 145 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 MDS2Q8NDY4 140 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 C7orf57Q8NEG2 295 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 PRR7Q8TB68 274 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 FAR1Q8WVX9 515 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 VMP1Q96GC9 406 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM237Q96Q45 408 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 DEFB126Q9BYW3 111 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ELOVL6Q9H5J4 265 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CDCP1Q9H5V8 836 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 VTI1BQ9UEU0 232 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 DCDC2Q9UHG0 476 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 POLEQ07864 2286 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1W2PPM1 405 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 SMIM23A6NLE4 172 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP6CO00743 305 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 LDB3O75112 727 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 GLRA3O75311 464 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 EEDO75530 441 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 SUPT7LO94864 414 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 KRT15P19012 456 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPAN8P19075 237 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 HSD17B3P37058 310 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CD96P40200 585 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 GPR143P51810 404 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 PRKAA2P54646 552 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 MLF1P58340 268 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 VSNL1P62760 191 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 OR1C1Q15619 314 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 UNC50Q53HI1 259 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF766Q5HY98 468 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 SH2D5Q6ZV89 423 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 NUDT13Q86X67 352 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC22A9Q8IVM8 553 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ARMC10Q8N2F6 343 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 MYRIPQ8NFW9 859 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TRPC4APQ8TEL6 797 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 NCLNQ969V3 563 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TAAR6Q96RI8 345 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD10Q9NXR5 420 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TRPS1Q9UHF7 1281 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 SNX6Q9UNH7 406 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ATG4BQ9Y4P1 393 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKUB1A6NFN9 424 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXO6A8MYZ6 492 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 FCHO1O14526 889 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 PROM1O43490 865 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TMPRSS11DO60235 418 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 FGF17O60258 216 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CDH16O75309 829 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 RASAL1O95294 804 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 SLU7O95391 586 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 MLYCDO95822 493 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 EDN3P14138 238 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 IMPDH1P20839 514 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 ID2Q02363 134 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 C18orf63Q68DL7 685 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 CYP20A1Q6UW02 462 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 HORMAD2Q8N7B1 307 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 MORN4Q8NDC4 146 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 OR14A16Q8NHC5 309 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 TANKQ92844 425 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 L3HYPDHQ96EM0 354 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-205ENST00000444916 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms