RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 ELP5Q8TE02 316 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CENPHQ9H3R5 247 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR41Q9HAD4 459 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CDK2AP1O14519 115 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 UROSP10746 265 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXA1P55317 472 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 C18orf63Q68DL7 685 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ATG14Q6ZNE5 492 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 COMMD6Q7Z4G1 85 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNA7Q96RP8 456 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ACPTQ9BZG2 426 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNK13Q9HB14 408 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SIRT5Q9NXA8 310 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 BIRC5O15392 142 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 LDB3O75112 727 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CRCPO75575 148 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZWINTO95229 277 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR75O95800 540 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GBAP04062 536 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 NR2F6P10588 404 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CHN1P15882 459 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 HTR6P50406 440 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR143P51810 404 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPK12P53778 367 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CASP8Q14790 479 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 NADK2Q4G0N4 442 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZS92 163 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CUZD1Q86UP6 607 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 LGI4Q8N135 537 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SIRT6Q8N6T7 355 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 HAS2Q92819 552 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PNPLA2Q96AD5 504 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 HBEGFQ99075 208 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MECRQ9BV79 373 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF32Q9H0A6 362 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 STMN3Q9NZ72 180 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DOCK10Q96BY6 2186 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SPTA1P02549 2419 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 A8MUA0 341 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 A8MUI8 341 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 NPIPB8E9PQR5 432 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 AZIN1O14977 448 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 FGF17O60258 216 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MYO1DO94832 1006 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 AIFM1O95831 613 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 IFNA16P05015 189 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DHRS4L1P0CG22 281 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINB3P29508 390 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINB4P48594 390 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TAS2R50P59544 299 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SPIN4Q56A73 249 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ABHD17BQ5VST6 288 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC6A19Q695T7 634 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GALNT18Q6P9A2 607 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 NUDCD3Q8IVD9 361 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC5A8Q8N695 610 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 AMER2Q8N7J2 671 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MORN4Q8NDC4 146 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJB14Q8TBM8 379 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TMBIM4Q9HC24 238 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 MCM8Q9UJA3 840 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 SCN2AQ99250 2005 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 DYTNA2CJ06 578 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA6L10A6NI86 522 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 TNNI3P19429 210 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 GALNSP34059 522 aa15.74■□□□□ 0.11
RABGEF1-204ENST00000442563 STT3AP46977 705 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms