RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD3Q9Y597 815 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC30A4O14863 429 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HCN1O60741 890 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QCP02747 245 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C9P02748 559 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ESR1P03372 595 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HPGDP15428 266 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 IL1RNP18510 177 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ADRA1AP35348 466 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYBB2P43320 205 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RABGGTBP53611 331 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GEMP55040 296 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CAV3P56539 151 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NT5C3BQ969T7 300 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 WBP1Q96G27 269 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO19Q96H55 970 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TPD52L3Q96J77 140 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SAMD11Q96NU1 681 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FEVQ99581 238 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 DPY30Q9C005 99 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SIK2Q9H0K1 926 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GLRX2Q9NS18 164 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 F8W036 122 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GREM1O60565 184 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAM11O75078 769 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DQB2P05538 268 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SYPP08247 313 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PCSK2P16519 638 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCL3P19876 107 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PUDPQ08623 228 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC14A1Q13336 389 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 IL18Q14116 193 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ATG9BQ674R7 924 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CNIH2Q6PI25 160 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RANBP10Q6VN20 620 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SERINC5Q86VE9 423 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 STPG2Q8N412 459 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LMAN2LQ9H0V9 348 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 IL23AQ9NPF7 189 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PPT2Q9UMR5 302 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNG2Q9Y698 323 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GVC2 190 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MROH6A6NGR9 719 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 BTN3A1O00481 513 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PIRO00625 290 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNG3O60359 315 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNDBP1O95273 360 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGN1P05114 100 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LMO2P25791 158 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CSKP41240 450 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3CGP48736 1102 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GZMMP51124 257 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 DGKEP52429 567 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 WNT3AP56704 352 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A12P80511 92 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM189BP81408 668 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HSF2Q03933 536 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 UGT8Q16880 541 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C22orf42Q6IC83 251 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms