RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428401.1

AC005300.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC005300.1, Length 373 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005300.1-201ENST00000428401 CDC14BO60729 498 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TMCC2O75069 709 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 DNAJB6O75190 326 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 JRKO75564 520 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TIPRLO75663 272 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 SCGB1D1O95968 90 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 F7P08709 466 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 INHBBP09529 407 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 H2AFZP0C0S5 128 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 COX6A1P12074 109 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 DESP17661 470 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 VCLP18206 1134 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 HK1P19367 917 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 MSH3P20585 1137 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 MMP11P24347 488 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ITGA3P26006 1051 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ACRV1P26436 265 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 CFPP27918 469 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 EPHA3P29320 983 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 PKLRP30613 574 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 CCR7P32248 378 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 FOXN2P32314 431 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 PGM1P36871 562 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 HADHAP40939 763 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 FOLR3P41439 243 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 GRIA1P42261 906 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ARHGAP25P42331 645 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TSFMP43897 325 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TNFSF10P50591 281 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 SEC24CP53992 1094 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 NR1H2P55055 460 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 DCDP81605 110 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 KLC1Q07866 573 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 CDC16Q13042 620 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 MPP3Q13368 585 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ITGA9Q13797 1035 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 SYT16Q17RD7 645 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ZNF385BQ569K4 471 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 VWA2Q5GFL6 755 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 LCE4AQ5TA78 99 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 LRRC38Q5VT99 294 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ATG9BQ674R7 924 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 KLHL35Q6PF15 583 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TTLL10Q6ZVT0 673 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 H2AFVQ71UI9 128 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ZNF534Q76KX8 674 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 PRSS41Q7RTY9 318 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 PID1Q7Z2X4 250 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 SNX20Q7Z614 316 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TRABD2AQ86V40 505 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TAX1BP1Q86VP1 789 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 VSIG1Q86XK7 387 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 RAB43Q86YS6 212 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 MED12LQ86YW9 2145 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 C1QL4Q86Z23 238 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 CCDC50Q8IVM0 306 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 PRSS58Q8IYP2 241 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 OR8H2Q8N162 312 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 KRT222Q8N1A0 295 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ZADH2Q8N4Q0 377 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 SIRT6Q8N6T7 355 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 AMER3Q8N944 861 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 OR13J1Q8NGT2 312 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 DNAJB14Q8TBM8 379 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 POC1BQ8TC44 478 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 HM13Q8TCT9 377 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 PPP4R1Q8TF05 950 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 NRGNQ92686 78 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 PTERQ96BW5 349 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 CNDP1Q96KN2 507 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 C10orf90Q96M02 699 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TTC25Q96NG3 672 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 SERINC2Q96SA4 455 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 CCM2Q9BSQ5 444 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 GBA3Q9H227 469 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 TRABDQ9H4I3 376 aa3.21□□□□□ -1.9
AC005300.1-201ENST00000428401 CHODLQ9H9P2 273 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms