RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421462.5

PKP4-204, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 3,099 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-204ENST00000421462 KCTD5Q9NXV2 234 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 POLHQ9Y253 713 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 SH3D21A4FU49 640 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 ATF6P18850 670 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 XKP51811 444 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 ARHGEF6Q15052 776 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 SLC5A12Q1EHB4 618 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 GPR52Q9Y2T5 361 aa15.88■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 C1orf226A1L170 272 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 CLDN11O75508 207 aa15.87■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 SLC9A3P48764 834 aa15.87■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 FGFBP1Q14512 234 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 NUMA1Q14980 2115 aa15.87■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 NXPE1Q8N323 547 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 UBTD2Q8WUN7 234 aa15.87■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 SPATA9Q9BWV2 254 aa15.87■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.87■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 A0A0U1RQF3 1178 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 CA12O43570 354 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 IGLV3-27P01718 113 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 SRP54P61011 504 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 9.2
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PKP4-204ENST00000421462 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 WDFY2Q96P53 400 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa15.86■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 LIM2P55344 173 aa15.86■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 TM9SF4Q92544 642 aa15.86■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 HCSTQ9UBK5 93 aa15.86■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 LHX3Q9UBR4 397 aa15.86■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 JUPP14923 745 aa15.86■□□□□ 0.13
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PKP4-204ENST00000421462 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 OLIG3Q7RTU3 272 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 LRR1Q96L50 414 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 ENPP4Q9Y6X5 453 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.85■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 MPZL2O60487 215 aa15.85■□□□□ 0.13
PKP4-204ENST00000421462 TOXO94900 526 aa15.85■□□□□ 0.13
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